gromada - Phylum
W biologii, A Phylum ( / f aɪ l əm / ; mnogiej : fyli ) na poziomie klasyfikacji lub stopnia taksonomicznej poniżej Brytanii i wyższej klasy . Tradycyjnie w botanice zamiast gromady używa się terminu podział , chociaż Międzynarodowy Kodeks Nomenklatury glonów, grzybów i roślin przyjmuje te terminy jako równoważne. W zależności od definicji królestwo zwierząt Animalia zawiera około 31 typów; królestwo roślin Plantae zawiera około 14, a królestwo grzybów Fungi zawiera około 8 typów. Aktualne badania w filogenetyki jest odkrywanie relacji między gromad, które są zawarte w większych kladami , jak wylinkowce i rośliny telomowe .
Ogólny opis
Termin gromada został ukuty w 1866 roku przez Ernsta Haeckela z greckiego phylon ( φῦλον , „rasa, pień”), spokrewniony z gromadą ( φυλή , „plemię, klan”). Haeckel zauważył, że gatunki stale ewoluowały w nowe gatunki, które wydawały się zachowywać kilka spójnych cech między sobą, a zatem niewiele cech, które odróżniały je jako grupę („samodzielna jedność”). „Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe aller Gatunki, welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. co można tłumaczyć jako: Być może jednak taka rzeczywista i całkowicie samodzielna jedność jest zbiorem wszystkich gatunków, które stopniowo wyewoluowały z jednej i tej samej wspólnej pierwotnej formy, jak na przykład wszystkie kręgowce. Nazywamy ten agregat [a] Stamm [tj. rasa] ( Phylon ). W roślinnego taksonomii , August Wilhelm Eichler (1883) rośliny podzielono na pięć grup wymienionych podziałów, to termin, który pozostaje w użyciu do dziś dla grup roślin, glonów i grzybów. Definicje zoologicznego gromad zmieniły się od swoich początków w sześciu Linneusza klas i czterech embranchements od Georges Cuvier .
Nieformalnie, typy mogą być traktowane jako zgrupowania organizmów oparte na ogólnej specjalizacji planu ciała . Najprościej rzecz ujmując, typ można zdefiniować na dwa sposoby: jako grupę organizmów o pewnym stopniu podobieństwa morfologicznego lub rozwojowego ( definicja fenetyczna ) lub grupę organizmów o pewnym stopniu pokrewieństwa ewolucyjnego ( definicja filogenetyczna ). Próba zdefiniowania poziomu hierarchii Linneusza bez odwoływania się do (ewolucyjnego) pokrewieństwa jest niezadowalająca, ale definicja fenetyczna jest użyteczna, gdy odpowiadamy na pytania natury morfologicznej – takie jak skuteczność różnych planów ciała.
Definicja oparta na relacji genetycznej
Najważniejszą obiektywną miarą w powyższych definicjach jest „pewny stopień”, który określa, w jaki sposób różne organizmy muszą być członkami różnych typów. Minimalnym wymaganiem jest, aby wszystkie organizmy w typie były wyraźnie bliżej spokrewnione ze sobą niż z jakąkolwiek inną grupą. Nawet to jest problematyczne, ponieważ wymaganie zależy od znajomości relacji między organizmami: w miarę dostępności większej ilości danych, zwłaszcza z badań molekularnych, jesteśmy w stanie lepiej określić relacje między grupami. Tak więc typy można łączyć lub dzielić, jeśli okaże się, że są ze sobą spokrewnione lub nie. Na przykład w połowie XX wieku robaki brodaty zostały opisane jako nowa gromada (Pogonophora), ale badania molekularne prawie pół wieku później wykazały, że są one grupą pierścienic , więc gromady się połączyły (robaki brodaty). są teraz rodziną annelidów ). Z drugiej strony, pasożytniczych Phylum wielokomórkowce pośrednie podzielono na dwie gromadami ( prostopływce i Rhombozoa ), gdy zostało wykryte w prostopływce prawdopodobnie wtórouste i Rhombozoa protostomes .
Ta zmienność typu skłoniła niektórych biologów do wezwania do porzucenia koncepcji typu na rzecz kladystyki , metody, w której grupy są umieszczane w „drzewie genealogicznym” bez żadnego formalnego rankingu wielkości grupy.
Definicja na podstawie planu ciała
Definicję typu opartego na planie ciała zaproponowali paleontolodzy Graham Budd i Sören Jensen (podobnie jak Haeckel sto lat wcześniej). Definicja została przyjęta, ponieważ wymarłe organizmy są najtrudniejsze do sklasyfikowania: mogą być odgałęzieniami, które odbiegały od linii gromady, zanim wszystkie cechy definiujące współczesną gromadę zostały nabyte. Zgodnie z definicją Budda i Jensena, typ jest definiowany przez zestaw cech wspólnych dla wszystkich jego żyjących przedstawicieli.
Takie podejście powoduje pewne drobne problemy — na przykład cechy przodków wspólne dla większości członków gromady mogły zostać utracone przez niektórych członków. Również ta definicja opiera się na arbitralnym momencie: teraźniejszości. Jednakże, ponieważ jest on oparty na charakterach, łatwo go zastosować do zapisu kopalnego. Większym problemem jest to, że opiera się na subiektywnej decyzji o tym, które grupy organizmów należy uznać za gromady.
Podejście to jest przydatne, ponieważ ułatwia klasyfikację wymarłych organizmów jako „ grup macierzystych ” do typu, do którego wykazują największe podobieństwo, opierając się jedynie na podobieństwach ważnych taksonomicznie. Jednak udowodnienie, że skamielina należy do grupy koronowej gromady, jest trudne, ponieważ musi wykazywać charakter unikalny dla podzbioru grupy koronowej. Co więcej, organizmy z grupy pnia gromady mogą posiadać „plan ciała” gromady bez wszystkich cech niezbędnych do tego, by się do niego zaliczyć. To osłabia ideę, że każdy z typów reprezentuje odrębny plan ciała.
Klasyfikacja wykorzystująca tę definicję może być silnie uzależniona od szansy przeżycia rzadkich grup, co może sprawić, że gromada będzie znacznie bardziej zróżnicowana niż byłaby w innym przypadku.
Znana gromada
Zwierząt
Liczby całkowite są szacunkami; dane pochodzące od różnych autorów znacznie się różnią, nie tylko dlatego, że niektóre opierają się na opisanych gatunkach, a niektóre na ekstrapolacji do liczby nieopisanych gatunków. Na przykład opisano około 25 000-27 000 gatunków nicieni, podczas gdy opublikowane szacunki dotyczące całkowitej liczby gatunków nicieni obejmują 10 000-20 000; 500 000; 10 milionów; i 100 milionów.
Protostom | Bilateria | |
Deuterostomy | ||
Podstawowe/sporne | ||
Inni |
Gromada | Oznaczający | Nazwa zwyczajowa | Charakterystyczne cechy | Opisane gatunki |
---|---|---|---|---|
Annelida | Mały pierścionek | Segmentowane robaki | Wiele okrągłych segmentów | 22 000 + istniejące |
Stawonogi | Stopa przegubowa | Stawonogi | Segmentowane ciała i kończyny połączone z egzoszkieletem chitynowym | 1 250 000 + istniejące; Ponad 20 000 wymarłych |
Brachiopoda | Ramię stopy | Muszle lamp | Lofofor i szypułka | 300 -500 istniejących; 12.000+ wymarły |
Mszycowate ( Ectoprocta ) | Zwierzęta z mchu | Mchy, maty morskie, ektoprokty | Lofofor, brak szypułki, macki rzęskowe , odbyt poza pierścieniem rzęsek | 6000 istniejących |
Chaetognatha | Długowłosa szczęka | Robaki strzałek | Chitynowe kolce po obu stronach głowy, płetwy | około. 100 istniejących |
Chordata | Ze sznurkiem | Chordaty | Wydrążony grzbietowy kręgowy nerwów , struny grzbietowej , gardła szczeliny , endostyl , po okresie Anal ogon | około. 55 000 + |
Cnidaria | Pokrzywa | Cnidarianie | Nicienie (komórki parzące) | około. 16 000 |
Ctenofora | Nośnik grzebienia | Galaretki grzebieniowe | Osiem „rzędów grzebieni” zrośniętych rzęsek | około. 100 -150 istniejących |
Cykliofora | Przenoszenie koła | Symbion | Okrągłe usta otoczone małymi rzęskami, przypominającymi worki | 3 + |
Szkarłupnia | Kolczasta skóra | Szkarłupnie | Pięciokrotna symetria promieniowa w organizmach żywych, mezodermalne zwapnione kolce | około. 7500 istniejących; około. 13 000 wymarłych |
Entoprocta | Wewnątrz odbytu | Robaki kubkowe | Odbyt wewnątrz pierścienia rzęsek | około. 150 |
Gastrotricha | Owłosiony brzuch | Robaki żołądkowe | Dwie końcówki samoprzylepne rurki | około. 690 |
Gnathostomulida | Otwór szczęki | Robaki szczękowe | około. 100 | |
Hemichordata | Połówkowy przewód | Robaki żołędzie, półstruny | Stomochord w kołnierzu, rozcięcia gardłowe | około. 130 istniejących |
Kinorhyncha | Pysk ruchu | Smoki błotne | Jedenaście segmentów, każdy z płytką grzbietową | około. 150 |
Loricifera | Gorset na okaziciela | Główki szczotek | Parasolowate łuski na każdym końcu | około. 122 |
Mikrognatozoa | Małe szczęki zwierząt | Limnognathia | Akordeonowa rozciągliwa klatka piersiowa | 1 |
Mięczak | Miękki | Mięczaki / mięczaki | Muskularny kolana i płaszcz runda skorupa | 85 000 + istniejące; 80 000+ wymarły |
Nematoda | Jak wątek | Okrągłe robaki, robaki nici | Przekrój okrągły, naskórek keratynowy | 25 000 |
Nicienie | Forma wątku | Robaki z włosia końskiego, robaki gordyjskie | około. 320 | |
Nemertea | Nimfa morska | Robaki wstążkowe, rhynchocoela | około. 1200 | |
Onychofora | Nosiciel pazurów | Aksamitne robaki | Nogi zakończone chitynowymi pazurami | około. 200 istniejących |
Phoronida | kochanka Zeusa | Robaki podkowy | Jelita w kształcie litery U | 11 |
Placozoa | Zwierzęta talerzowe | Trichoplaksy | Zróżnicowane powierzchnie górna i dolna, dwie warstwy komórek rzęskowych, między nimi komórki włókien ameboidalnych | 3 |
Platyhelminty | Płaski robak | Płazińce | około. 29 500 | |
Porifera | Nosiciel porów | Gąbki | Perforowana ściana wewnętrzna | 10 800 istniejących |
Priapulida | Mały Priapus | Robaki penisa | około. 20 | |
Rhombozoa ( Dicyemida ) | Zwierzę do ssania | Rombozoany | Pojedyncza komórka osiowa przednio-tylna otoczona komórkami rzęskowymi | 100 + |
Rotifera | Nośnik koła | Wrotki | Przednia korona rzęsek | około. 2000 |
Tardigrada | Powolny krok | Niedźwiedzie wodne, Prosięta mchu | Czterosegmentowy korpus i głowa | 1000 |
ksenakoelomorfa | Dziwna pusta forma | Acoele, ksenoturbellidy | Obustronny , ale pozbawiony typowych struktur dwubocznych, takich jak jamy jelitowe, odbyty i układ krążenia | 400 + |
Razem: 31 | 1,525 000 |
Rośliny
Królestwo Plantae jest definiowane na różne sposoby przez różnych biologów (patrz aktualne definicje Plantae ). Wszystkie definicje obejmują żywe embriofity (rośliny lądowe), do których można dodać dwie grupy zielenic, Chlorophyta i Charophyta , tworząc klad Viridiplantae . Poniższa tabela podąża za wpływowym (choć kontrowersyjnym) systemem Cavalier-Smith w utożsamianiu „Plantae” z Archaeplastida , grupą zawierającą Viridiplantae i algi Rhodophyta i Glaucophyta .
Definicja i klasyfikacja roślin na poziomie podziału również różni się w zależności od źródła i zmieniała się stopniowo w ostatnich latach. Tak więc niektóre źródła umieszczają skrzypy w dywizji Arthrophyta i paprocie w dywizji Monilophyta, podczas gdy inne umieszczają je w dywizji Monilophyta, jak pokazano poniżej. Podział Pinophyta może być stosowany dla wszystkich roślin nagonasiennych (tj. w tym sagowców, miłorzębów i gnetofitów) lub dla samych drzew iglastych, jak poniżej.
Od czasu pierwszej publikacji systemu APG w 1998 roku, w której zaproponowano klasyfikację roślin okrytozalążkowych do poziomu rzędów , wiele źródeł wolało traktować rangi wyższe niż rzędy jako klady nieformalne. Tam, gdzie przewidziano rangi formalne, tradycyjne podziały wymienione poniżej zostały zredukowane do znacznie niższego poziomu, np . podklasy .
Rośliny lądowe | Viridiplantae | |
Zielone algi | ||
Inne glony ( Biliphyta ) |
Podział | Oznaczający | Nazwa zwyczajowa | Cechy wyróżniające | Opisane gatunki |
---|---|---|---|---|
Anthocerotophyta | Rośliny podobne do antoceros | Hornworts | Sporofity w kształcie rogu , bez układu naczyniowego | 100 -300+ |
Bryophyta | Rośliny podobne do Bryum , rośliny mchu | Mchy | Trwałe nierozgałęzione sporofity , brak układu naczyniowego | około. 12.000 |
Charophyta | Rośliny podobne do Chara | Charofity | około. 1000 | |
Chlorofita | (Żółto-)zielone rośliny | Chlorofity | około. 7000 | |
Cycadophyta | Rośliny podobne do Cycas , rośliny przypominające palmy | Sagowce | Nasiona, korona liści złożonych | około. 100 -200 |
Ginkgophyta | Rośliny podobne do miłorzębu | Miłorząb, miłorząb | Nasiona niechronione przez owoce (pojedynczy żywy gatunek) | tylko 1 zachowany; 50+ wymarły |
Glaucophyta | Niebiesko-zielone rośliny | Glaukofity | 15 | |
Gnetophyta | Rośliny podobne do gnetum | Gnetofity | Nasiona i zdrewniały układ naczyniowy z naczyniami | około. 70 |
Likopodiofita , |
Rośliny podobne do lycopodium Wilcze rośliny |
Mchy kłujące i kolczaste | Liście mikrofili , układ naczyniowy | 1290 istniejących |
Magnoliophyta | Rośliny podobne do magnolii | Rośliny kwitnące, okrytozalążkowe | Kwiaty i owoce, układ naczyniowy z naczyniami | 300 000 |
Marchantiophyta , Hepatofita |
Marchantia rośliny -Jak Rośliny wątrobowe |
Wątrobowce | Efemeryczne nierozgałęzione sporofity , brak układu naczyniowego | około. 9000 |
polipodiofita , |
Rośliny podobne do Polypodium |
Paprocie | Liście megafilne , układ naczyniowy | około. 10,560 |
Pinophyta , Coniferophyta |
Rośliny podobne do sosny Roślina stożkowa |
Drzewa iglaste | Szyszki zawierające nasiona i drewno złożone z tracheid | 629 istniejących |
Rhodophyta | Rośliny różane | Czerwone algi | Użyj fikobiliprotein jako pigmentów pomocniczych . | około. 7000 |
Razem: 14 |
Grzyby
Podział | Oznaczający | Nazwa zwyczajowa | Cechy wyróżniające | Opisane gatunki |
---|---|---|---|---|
Ascomycota | Grzyb pęcherza moczowego | Workowce, grzyby workowe | Zwykle mają owocniki (askokarp). Nitkowate, wytwarzające strzępki oddzielone przegrodami. Może rozmnażać się bezpłciowo. | 30 000 |
Basidiomycota | Mały grzyb podstawowy | Basidiomycetes, grzyby maczugowe | Grzyby wspornikowe, muchomory, smutki i rdza. Rozmnażanie płciowe. | 31 515 |
Blastocladiomycota | Grzyb odgałęziony | Blastoclads | Mniej niż 200 | |
Chytridiomycota | Mały garnek do gotowania | Chytrids | Głównie wodne saprotroficzne lub pasożytnicze. Mieć tylną wić . Zwykle są jednokomórkowe, ale mogą być również wielokomórkowe. | 1000+ |
Glomeromycota | Kula grzyba przędzy | Glomeromycetes, grzyby AM | Występują głównie mikoryzy arbuskularne, lądowe z niewielką obecnością na terenach podmokłych. Rozmnażanie jest bezpłciowe, ale wymaga korzeni roślin. | 284 |
Mikrosporydia | Małe nasiona | Mikrospory | 1400 | |
Neocallimastigomycota | Nowy piękny grzyb biczowy | Neocallimastigomycetes | Znajduje się głównie w przewodzie pokarmowym zwierząt roślinożernych. Anaerobowe, lądowe i wodne. | około. 20 |
Zygomycota | Para grzybów | Zygomycetes | Większość to saproby i rozmnażają się płciowo i bezpłciowo. | ok. 1060 |
Razem: 8 |
Phylum Microsporidia jest ogólnie zaliczana do królestwa Fungi, chociaż jej dokładne relacje pozostają niepewne i jest uważana za pierwotniaka przez Międzynarodowe Towarzystwo Protistologów (patrz Protista poniżej). Analiza molekularna Zygomycota wykazała, że jest ona polifiletyczna (jej członkowie nie mają wspólnego przodka), co wielu biologów uważa za niepożądane. W związku z tym istnieje propozycja zniesienia gromady Zygomycota. Jego członkowie zostaliby podzieleni na gromadę Glomeromycota i cztery nowe subphyla incertae sedis (o niepewnym umiejscowieniu): Entomophthoromycotina , Kickxellomycotina , Mucoromycotina i Zoopagomycotina .
Protista
Kingdom Protista (lub Protoctista) jest częścią tradycyjnego modelu pięciu lub sześciu królestw, w którym można go zdefiniować jako zawierający wszystkie eukarionty , które nie są roślinami, zwierzętami ani grzybami. Protista jest taksonem polifiletycznym , mniej akceptowanym przez współczesnych biologów niż w przeszłości. Pojawiły się propozycje, aby podzielić ją między kilka nowych królestw, takich jak Protozoa i Chromista w systemie Cavalier-Smith .
Taksonomia protistów od dawna jest niestabilna, a różne podejścia i definicje skutkują wieloma konkurencyjnymi schematami klasyfikacji. Wymienione tutaj typy są używane dla Chromista i Protozoa przez Katalog Życia , zaadaptowany z systemu używanego przez Międzynarodowe Towarzystwo Protistologów.
Harosa | |
pierwotniaki |
gromada/oddział | Oznaczający | Nazwa zwyczajowa | Cechy wyróżniające | Przykład | Opisane gatunki |
---|---|---|---|---|---|
Amebozoa | Zwierzę amorficzne | Ameby | Obecność pseudopodia | Ameba | 2400 |
Bigyra | Dwa pierścienie | ||||
Cercozoa | |||||
Choanozoa | Lejek zwierzę | Obecność pierścienia mikrokosmków otaczających wić | 125 | ||
Ciliofora | Nosiciel rzęsek | Ciliates | Obecność mnogich rzęsek i cytostomu | Pantofelek | 4500 |
Kryptista | Ukryty | ||||
Euglenozoa | Prawdziwe oko zwierząt | Euglena | 800 | ||
otwornice | Nośniki otworów | Formy | Skomplikowane pociski z jedną lub więcej komorami | Formy | 10000, 50000 wymarły |
Haptofita | |||||
Loukozoa | Zwierzę z rowkiem | ||||
Metamonada | Średnie organizmy jednokomórkowe | Giardia | |||
Mikrosporydia | Małe zarodniki | ||||
Myzozoa | Zwierze ssące | 1555+ | |||
Ochrophyta | Żółta roślina | Okrzemki | |||
Oomycota | Grzyb jajeczny | Oomycetes | |||
Perkolozoa | |||||
Radiozoa | Ray zwierzę | Radiolarians | |||
Sarkomastigofora | Posiadacz ciała i bata | ||||
Sulkozoa | |||||
Razem: 19 |
Katalog życia obejmuje Rhodophyta i Glaucophyta w królestwie Plantae, ale inne systemy uważają te typy za część Protista.
Bakteria
Obecnie istnieje 29 typów zaakceptowanych przez Listę imion prokariotycznych ze statusem w nomenklaturze (LPSN)
- Acidobacteria , fenotypowo zróżnicowane i w większości niehodowlane
- Promieniowce , gatunki Gram-dodatnie o wysokim poziomie G+C
- Aquificae , tylko 14 rodzajów ciepłolubnych, głęboko rozgałęzione
- Armatimonadetes
- Bacteroidetes
- Caldiserica , poprzednio kandydujący oddział OP5, Caldisericum exile jest jedynym przedstawicielem
- Chlamydiae , tylko 6 rodzajów
- Chlorobi , tylko 7 rodzajów, zielone bakterie siarkowe
- Chloroflexi , zielone bakterie bezsiarkowe
- Chrysiogenetes jedynie trzy rodzaje ( Chrysiogenes arsenatis , Desulfurispira natronophila , Desulfurispirillum alkaliphilum )
- Sinice , znane również jako niebiesko-zielone algi
- Deferribakterie
- Deinococcus-Thermus , Deinococcus radiodurans i Thermus aquaticus są "powszechnie znanymi" gatunkami tej gromady
- Dictyoglomi
- Elusimikrobia , poprzednio kandydujący oddział Thermite Group 1
- Fibrobakterie
- Firmicutes , gatunki Gram-dodatnie o niskiej zawartości G+C, takie jak tworzące zarodniki Bacilli (tlenowe) i Clostridia (beztlenowe)
- Fuzobakterie
- Gemmatimonadetes
- Lentisphaerae , dawniej klad VadinBE97
- Nitrospira
- Planctomycetes
- Proteobacteria , najbardziej znana gromada zawierająca gatunki takie jak Escherichia coli lub Pseudomonas aeruginosa
- Krętki , gatunki obejmują Borrelia burgdorferi , który powoduje boreliozę
- Synergetyki
- Tenericutes , alternatywnie klasa Mollicutes in phylum Firmicutes (znaczny rodzaj: Mycoplasma )
- Termodesulfobakterie
- Termotogi , głębokie rozgałęzienia
- Werrukomikrobia
Archea
Obecnie istnieje pięć typów akceptowanych na Liście nazw prokariotycznych ze statusem w nomenklaturze (LPSN).
- Crenarchaeota , druga co do częstości gromada archeonów
- Euryarchaeota , najczęściej spotykana gromada archeonów
- Korarchaeota
- Nanoarchaeota , ultramałe symbionty, jeden znany gatunek
- Thaumarchaeota