LAMPA1 - LAMP1
Lizosomalnej związane białko błonowe 1 ( Lampa 1 ), znany również jako lizosomów glikoproteiny związane z błoną 1 i CD107a ( C połysk D ifferentiation 107a) jest białkiem , które dla ludzi są kodowane przez Lampa 1 genu . Ludzki gen LAMP1 znajduje się na długim ramieniu (q) chromosomu 13 w regionie 3, prążku 4 (13q34).
Lizosomalnej związane białko błonowe 1 jest glikoproteiną z rodziny lizosomów związanego glikoprotein błonowych . Glikoproteina LAMP-1 jest białkiem transbłonowym typu I, które ulega ekspresji na wysokim lub średnim poziomie w co najmniej 76 różnych typach komórek normalnej tkanki. Znajduje się głównie w błonach lizosomalnych i działa dostarczając selektyny z ligandami węglowodanowymi . Wykazano również, że CD107a jest markerem degranulacji na limfocytach, takich jak komórki CD8+ i NK . i może również odgrywać rolę w guz różnicowania komórek i przerzuty .
Struktura
Znajdujące się głównie w poprzek błon lizosomalnych, te glikoproteiny składają się z dużego, wysoce glikozylowanego końca z łańcuchami węglowymi połączonymi przez N po stronie światła błony i krótkiego C-końcowego ogona wystawionego na cytoplazmę . Region pozacytoplazmatyczny zawiera strukturę podobną do zawiasu, która może tworzyć mostki dwusiarczkowe homologiczne do tych obserwowanych w ludzkiej immunoglobulinie A . Inne cechy struktury glikoprotein LAMP-1 to:
- Polipeptyd rdzenia wynosi około 40 kDa
- 18 miejsc { N-glikozylacji } pomagających w dodaniu łańcuchów cukrowych
- Polilaktozaminowe przyłącza chroniące glikoproteinę przed degradacją przez proteazy lizosomalne
- Znaczne ilości polylactosaminoglycan i kwasu sialowego przemierzać trans aparatu Golgiego cystern .
- grupy poli-N-acetylolaktozaminowe zaangażowane w interakcje z selektyną i innymi białkami wiążącymi glikan
Funkcjonować
Glikoproteiny LAMP1 i LAMP2 stanowią 50% wszystkich białek błony lizosomalnej i uważa się, że są one częściowo odpowiedzialne za utrzymanie integralności lizosomów, pH i katabolizmu . Ekspresja glikoprotein LAMP1 i LAMP2 jest połączona, ponieważ niedobory genu LAMP1 będą prowadzić do zwiększonej ekspresji glikoprotein LAMP2. Uważa się zatem, że obie te osoby mają podobne funkcje in vivo . Jednak czyni to określenia dokładnej funkcji Lampa 1 trudne, ponieważ podczas Lampa 1 niedobór fenotypu niewiele różni się od typu dzikiego, ze względu na Lampy2 się rozporządzenia, Lampa 1 / Lampy2 podwójne z niedoborem prowadzi fenotyp zarodka śmiertelności.
Chociaż glikoproteiny LAMP1 znajdują się głównie w błonach lizosomalnych, w niektórych przypadkach mogą ulegać ekspresji w błonie plazmatycznej komórki. Ekspresja LAMP1 na powierzchni komórki może wystąpić z powodu fuzji lizosomalnej z błoną komórkową. Ekspresja LAMP1 na powierzchni komórki może służyć jako ligand dla selektyn i pomagać w pośredniczeniu w adhezji komórka-komórka . W związku z tym ekspresję LAMP1 na powierzchni komórki obserwuje się w komórkach o funkcjach migracyjnych lub inwazyjnych, takich jak cytotoksyczne limfocyty T , płytki krwi i makrofagi . Ekspresja LAMP1 i LAMP2 na powierzchni komórki jest również często obserwowana w komórkach nowotworowych , szczególnie rakach o wysokim potencjale przerzutowym, takich jak rak okrężnicy i czerniak, i wykazano, że koreluje z ich potencjałem przerzutowym.
Rola w raku
Lampa 1 ekspresji na powierzchni komórek rakowych obserwowano w wielu różnych typach nowotworów, szczególnie w bardzo przerzutów nowotworów, takich jak rak trzustki , raka okrężnicy i czerniaka . Struktura LAMP1 koreluje z różnicowaniem i potencjałem przerzutowym komórek nowotworowych, ponieważ uważa się, że pomaga ona pośredniczyć w adhezji i migracji komórka-komórka . Rzeczywiście, w adhezji niektórych komórek rakowych do macierzy zewnątrzkomórkowej pośredniczą interakcje między LAMP1 i LAMP2 oraz E-selektyną i galektynami , przy czym LAMP służą jako ligandy dla cząsteczek adhezji komórek.
Ekspresja LAMP-1 w błonie komórkowej obserwowana w następujących typach nowotworów:
- ludzki włókniakomięsak ,
- gruczolakorak jelita grubego ,
- czerniaka ,
- gruczolakorak trzustki i
- Gwiaździak .
Zobacz też
Bibliografia
Dalsza lektura
- Chang MH, Karageorgos LE, Meikle PJ (2003). „CD107a (LAMP-1) i CD107b (LAMP-2)”. Journal of Biological Regulators and Homeostatics Agents . 16 (2): 147–51. PMID 12144129 .
- Schleutker J, Haataja L, Renlund M, Puhakka L, Viitala J, Peltonen L, Aula P (listopad 1991). „Potwierdzenie lokalizacji chromosomów ludzkich genów lampowych i ich wykluczenia jako genów kandydujących do choroby Salla”. Genetyka człowieka . 88 (1): 95-7. doi : 10.1007/BF00204936 . PMID 1959930 . S2CID 31520394 .
- Carlsson SR, Fukuda M (listopad 1990). „Polilaktozoaminoglikany ludzkich glikoprotein błony lizosomalnej lampa-1 i lampa-2. Lokalizacja na szkieletach peptydowych” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 265 (33): 20488-95. doi : 10.1016/S0021-9258(17)30530-6 . PMID 2243102 .
- Mattei MG, Matterson J, Chen JW, Williams MA, Fukuda M (maj 1990). „Dwie ludzkie glikoproteiny błony lizosomalnej, h-lamp-1 i h-lamp-2, są kodowane przez geny zlokalizowane odpowiednio w chromosomie 13q34 i chromosomie Xq24-25” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 265 (13): 7548–51. doi : 10.1016/S0021-9258(19)39148-3 . PMID 2332441 .
- Carlsson SR, Fukuda M (grudzień 1989). „Struktura ludzkiej glikoproteiny błony lizosomalnej 1. Przyporządkowanie wiązań dwusiarczkowych i wizualizacja układu jej domen” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 264 (34): 20526-31. doi : 10.1016/S0021-9258(19)47094-4 . PMID 2584229 .
- Mane SM, Marzella L, Bainton DF, Holt VK, Cha Y, Hildreth JE, sierpień JT (styczeń 1989). „Oczyszczanie i charakterystyka ludzkich glikoprotein błony lizosomalnej”. Archiwum Biochemii i Biofizyki . 268 (1): 360-78. doi : 10.1016/0003-9861(89)90597-3 . PMID 2912382 .
- Viitala J, Carlsson SR, Siebert PD, Fukuda M (czerwiec 1988). „Klonowanie molekularne cDNA kodujących lampę A, ludzką glikoproteinę błony lizosomalnej o pozornym Mr w przybliżeniu równym 120 000” . Materiały Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych Ameryki . 85 (11): 3743–7. Kod Bibcode : 1988PNAS...85.3743V . doi : 10.1073/pnas.85.11.3743 . PMC 280294 . PMID 3131762 .
- Howe CL, Granger BL, Hull M, Green SA, Gabel CA, Helenius A, Mellman I (październik 1988). „Pochodna sekwencja białkowa, oligosacharydy i wstawienie do błony 120 kDa lizosomalnej glikoproteiny błony lizosomalnej (lgp120): identyfikacja wysoce konserwatywnej rodziny lizosomalnych glikoprotein błony” . Materiały Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych Ameryki . 85 (20): 7577-81. Kod Bib : 1988PNAS...85.7577H . doi : 10.1073/pnas.85.20.7577 . PMC 282235 . PMID 3174652 .
- Fukuda M, Viitala J, Matteson J, Carlsson SR (grudzień 1988). „Klonowanie cDNA kodujących ludzkie glikoproteiny błony lizosomalnej h-lamp-1 i h-lamp-2. Porównanie ich wydedukowanych sekwencji aminokwasowych” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 263 (35): 18920-8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)37370-8 . PMID 3198605 .
- Ohno H, Stewart J, Fournier MC, Bosshart H, Rhee I, Miyatake S, Saito T, Gallusser A, Kirchhausen T, Bonifacino JS (wrzesień 1995). „Interakcja sygnałów sortowania opartych na tyrozynie z białkami związanymi z klatryną”. Nauka . 269 (5232): 1872-5. Kod Bibcode : 1995Sci...269.1872O . doi : 10.1126/science.7569928 . PMID 7569928 .
- Carlsson SR, Lycksell PO, Fukuda M (lipiec 1993). „Przypisanie miejsc przyłączenia O-glikanów do regionów zawiasopodobnych ludzkich glikoprotein błony lizosomalnej lampy-1 i lampy-2”. Archiwum Biochemii i Biofizyki . 304 (1): 65-73. doi : 10.1006/abbi.1993.1322 . PMID 8323299 .
- Sawada R, Jardine KA, Fukuda M (kwiecień 1993). „Geny głównych glikoprotein błony lizosomalnej, sekwencja lampy-1 i lampy-2,5'-flankującej genu lampy-2 i porównanie organizacji eksonów w dwóch genach” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 268 (12): 9014–22. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52972-0 . PMID 8517882 .
- Rohrer J, Schweizer A, Russell D, Kornfeld S (luty 1996). „Kierowanie Lamp1 do lizosomów zależy od odległości motywu sortowania tyrozyny w ogonie cytoplazmatycznym względem błony” . Czasopismo Biologii Komórki . 132 (4): 565–76. doi : 10.1083/jcb.132.4.565 . PKW 2199866 . PMID 8647888 .
- Höning S, Sandoval IV, von Figura K (sierpień 1998). „Motyw oparty na di-leucynie w ogonie cytoplazmatycznym LIMP-II i tyrozynaza pośredniczy w selektywnym wiązaniu AP-3” . Dziennik EMBO . 17 (5): 1304-14. doi : 10.1093/emboj/17.5.1304 . PMC 1170479 . PMID 9482728 .
- Furuta K, Yang XL, Chen JS, Hamilton SR, sierpień JT (maj 1999). „Różnicowa ekspresja białek błonowych związanych z lizosomami w normalnych tkankach ludzkich”. Archiwum Biochemii i Biofizyki . 365 (1): 75-82. doi : 10.1006/abbi.1999.1147 . PMID 10222041 .
- Raposo G, Moore M, Innes D, Leijendekker R, Leigh-Brown A, Benaroch P, Geuze H (październik 2002). „Ludzkie makrofagi gromadzą cząstki HIV-1 w przedziałach MHC II”. Ruch uliczny . 3 (10): 718–29. doi : 10.1034/j.1600-0854.2002.31004.x . PMID 12230470 . S2CID 7055266 .
- Zhang H, Li XJ, Martin DB, Aebersold R (czerwiec 2003). „Identyfikacja i oznaczanie ilościowe N-połączonych glikoprotein przy użyciu chemii hydrazydów, stabilnego znakowania izotopów i spektrometrii masowej”. Biotechnologia przyrodnicza . 21 (6): 660–6. doi : 10.1038/nbt827 . PMID 12754519 . S2CID 581283 .
Zewnętrzne linki
- LAMP1+białko,+człowiek w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)
- PDBe-KB zawiera przegląd wszystkich informacji o strukturze dostępnych w PDB dla glikoproteiny błonowej związanej z ludzkim lizosomem 1
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .