ELMO1 - ELMO1

ELMO1
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	2RQR , 2VSZ , 3A98
Identyfikatory
Skróty	ELMO1 , CED-12, CED12, ELMO-1, pochłonięcie i ruchliwość komórek 1
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 606420 MGI : 2153044 HomoloGene : 56685 Karty genetyczne : ELMO1
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 7 (ludzki)
Kończyć się	37 449 223 pb
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 13 (mysz)
Kończyć się	20 608 353 pb
Wzór ekspresji RNA
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• Aktywność czynnika wymiany guanylowo-nukleotydowej ; • Wiązanie domeny SH3 ; • Wiązanie białek GO:0001948;
Komponent komórkowy	• cytozol ; • cytoplazma ; • kompleks czynnika wymiany guanylowo-nukleotydowej ; • błona plazmatyczna ; • błona;
Proces biologiczny	• Ścieżka sygnalizacyjna receptora Fc-gamma zaangażowana w fagocytozę ; • Proces oparty na włóknach aktynowych ; • Regulacja odpowiedzi obronnej na wirusa przez wirusa ; • Fagocytoza, pochłonięcie ; • Ścieżka sygnalizacyjna receptora czynnika wzrostu śródbłonka naczyniowego ; • Fagocytoza ; • Transdukcja sygnału białka Rac ; • Migracja komórek ; • Cytoszkielet aktynowy organizacja ; • proces apoptotyczny ; • ruchliwość komórek ; • regulacja funkcji molekularnych;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	9844
	140580
	ENSG00000155849
	ENSMUSG00000041112
	Q92556
	Q8BPU7
	NM_001039459 ; NM_001206480 ; NM_001206482 ; NM_014800 ; NM_130442
	NM_080288 ; NM_198093
	NP_001034548 ; NP_001193409 ; NP_001193411 ; NP_055615 ; NP_569709
	NP_525027 ; NP_932761
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko pochłaniania i ruchliwości komórki 1 jest białkiem, które u ludzi jest kodowane przez gen ELMO1 . ELMO1 znajduje się na chromosomie numer siedem u ludzi i jest zlokalizowany na chromosomie numer trzynaście u myszy.

Struktura

Ludzkie białko pochłaniania i ruchliwości komórek 1, ELMO1, ma długość 720 reszt. Białko zawiera następujące trzy domeny:

N-końcowy Armadillo domen (reszty 82-262)
Środkowa ELMO ( E ngulfment i Cel l Mo tility) domenę (301-492)
C-końcowa domena homologii plekstryny (reszty 527-674)

ELMO1 ma również motyw pro-bogaty na skrajnym końcu C. Analiza struktury drugorzędowej przewidziała, że na końcu N i C znajdują się regiony alfa-helikalne.

Strukturę domeny homologicznej plekstryny ELMO1 określono metodą krystalografii rentgenowskiej.

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen oddziałuje z dedykatorem białka cytokinezy 1, promując fagocytozę i wpływając na zmiany kształtu komórki. Podobieństwo do białka C. elegans sugeruje, że białko to może działać w apoptozie i migracji komórek. Alternatywny splicing tego genu skutkuje wieloma wariantami transkrypcyjnymi kodującymi różne izoformy.

Interakcje

Wykazano, że ELMO1 współdziała z Dock180 i HCK . ELMO1 bezpośrednio oddziałuje z domeną SH3 HCK. Związek między ELMO1 i HCK jest zależny od interakcji poliproliny.

Kiedy ELMO1 jest skompleksowany z DOCK180, aktywowane są procesy biologiczne zależne od GTPazy Rac . Domena pH ELMO1 działa in trans, stabilizując DOCK180 i czyniąc go odpornym na degradację. Kiedy ELMO1 wiąże się z DOCK180, łagodzi steryczną inhibicję DOCK180, która następnie aktywuje GTPazę Rac. Probogaty motyw końca C na ELMO1 jest niezbędny do wiązania ELMO1 z domeną SH3 na końcu N DOCK180. Kompleks ELMO1 i DOCK180 działa jako regulator Rac podczas rozwoju komórki i migracji komórek. Mutacja obu miejsc interakcji dla DOCK180 na ELMO1 doprowadzi do zakłócenia kompleksu ELMO1-DOCK180. ELMO1 skompleksowany zarówno z DOCK180, jak i CrkII prowadzi do maksymalnej wydajności fagocytozy w komórce. Ten kompleks cząsteczek występuje przed Rac podczas fagocytozy.

Bibliografia

Dalsza lektura

Ohara O, Nagase T, Ishikawa K, et al. (1997). „Budowa i charakterystyka bibliotek cDNA ludzkiego mózgu odpowiednich do analizy klonów cDNA kodujących stosunkowo duże białka” . DNA Res . 4 (1): 53–9. doi : 10.1093/dnares/4.1.53 . PMID 9179496 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Genom Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Scott MP, Zappacosta F, Kim EY i in. (2002). „Identyfikacja nowych ligandów domeny SH3 dla rodziny Src kinazy Hck. białka zespołu Wiskotta-Aldricha (WASP), białka oddziałującego z WASP (WIP) i ELMO1” . J. Biol. Chem . 277 (31): 28238-46. doi : 10.1074/jbc.M202783200 . PMID 12029088 .
Brugnera E, Haney L, Grimsley C, et al. (2002). „Niekonwencjonalne działanie Rac-GEF odbywa się za pośrednictwem kompleksu Dock180-ELMO”. Nat. Biol komórki . 4 (8): 574–82. doi : 10.1038/ncb824 . PMID 12134158 . S2CID 36363774 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości ludzkich i mysich sekwencji cDNA” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 99 (26): 16899-903. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). „Ludzki chromosom 7: sekwencja DNA i biologia” . Nauka . 300 (5620): 767–72. Kod Bibcode : 2003Sci...300..767S . doi : 10.1126/science.1083423 . PMC 2882961 . PMID 12690205 .
Sanui T, Inayoshi A, Noda M, et al. (2003). „DOCK2 reguluje aktywację Rac i reorganizację cytoszkieletu poprzez interakcję z ELMO1”. Krew . 102 (8): 2948-50. doi : 10.1182/krew-2003-01-0173 . PMID 12829596 .
Katoh H, Negishi M (2003). „RhoG aktywuje Rac1 przez bezpośrednią interakcję z białkiem wiążącym Dock180 Elmo”. Natura . 424 (6947): 461-4. Kod bib : 2003Natur.424..461K . doi : 10.1038/nature01817 . PMID 12879077 . S2CID 4411133 .
Grimsley CM, Kinchen JM, Tosello-Trampont AC, et al. (2004). „Białka Dock180 i ELMO1 współpracują w promowaniu ewolucyjnie zachowanej migracji komórek zależnej od Rac” . J. Biol. Chem . 279 (7): 6087–97. doi : 10.1074/jbc.M307087200 . PMID 14638695 .
Wang X, Wu YC, Fadok VA i in. (2003). „Pochłanianie zwłok komórek za pośrednictwem receptora fosfatydyloseryny C. elegans przez CED-5 i CED-12”. Nauka . 302 (5650): 1563-6. Kod bib : 2003Sci...302.1563W . doi : 10.1126/science.1087641 . PMID 14645848 . S2CID 25672278 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21,243 pełnej długości ludzkich cDNA” . Nat. Genet . 36 (1): 40-5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Janardhan A, Swigut T, Hill B, et al. (2006). „HIV-1 Nef wiąże kompleks DOCK2-ELMO1, aby aktywować rac i hamować chemotaksję limfocytów” . PLOS Biol . 2 (1): E6. doi : 10.1371/journal.pbio.0020006 . PMC 314466 . PMID 14737186 .
Lu M, Kinchen JM, Rossman KL i in. (2004). „Domena PH funkcji ELMO w trans do regulacji aktywacji Rac poprzez Dock180”. Nat. Struktura. Mol. Biol . 11 (8): 756–62. doi : 10.1038/nsmb800 . PMID 15247908 . S2CID 125990 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Status, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: Kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121-7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
deBakker CD, Haney LB, Kinchen JM, et al. (2005). "Fagocytoza komórek apoptotycznych jest regulowana przez moduł sygnalizacyjny UNC-73/TRIO-MIG-2/RhoG i powtórzenia pancernika CED-12/ELMO" . Aktualn. Biol . 14 (24): 2208-16. doi : 10.1016/j.cub.2004.12.029 . PMID 15620647 . S2CID 1269946 .
Akakura S, Kar B, Singh S, et al. (2005). „C-końcowa domena SH3 CrkII reguluje składanie i funkcję DOCK180/ELMO Rac-GEF”. J. Komórka. Fizjol . 204 (1): 344–51. doi : 10.1002/jcp.20288 . PMID 15700267 . S2CID 29767556 .
Lu M, Kinchen JM, Rossman KL i in. (2005). „Model hamowania sterycznego do regulacji wymiany nukleotydów za pośrednictwem rodziny Dock180 GEF” . Aktualn. Biol . 15 (4): 371–7. doi : 10.1016/j.cub.2005.01.050 . PMID 15723800 . S2CID 14267018 .
Shimazaki A, Kawamura Y, Kanazawa A, et al. (2005). „Zmiany genetyczne w genie kodującym ELMO1 są związane z podatnością na nefropatię cukrzycową” . Cukrzyca . 54 (4): 1171–8. doi : 10.2337/cukrzyca.54.4.1171 . PMID 15793258 .
Yokoyama N, deBakker CD, Zappacosta F, et al. (2005). „Identyfikacja reszt tyrozynowych na ELMO1, które są fosforylowane przez kinazę Hck z rodziny Src” . Biochemia . 44 (24): 8841-9. doi : 10.1021/bi0500832 . PMC 2441568 . PMID 15952790 .

Ten artykuł o genie na ludzkim chromosomie 7 jest skrótem . Możesz pomóc Wikipedii, rozwijając ją .

Languages

In other projects