BTRC (gen) - BTRC (gene)

BTRC
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	1P22 , 2P64
Identyfikatory
Skróty	BTRC , BETA-TRCP, FBW1A, FBXW1, FBXW1A, FWD1, bTrCP, bTrCP1, betaTrCP, powtórzenie beta-transducyny zawierające ligazę białka ubikwityny E3
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 603482 MGI : 1338871 HomoloGene : 39330 Karty genetyczne : BTRC
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 10 (człowiek)
Kończyć się	101 557 321 pb
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 19 (mysz)
Kończyć się	45 530 013 pb
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• GO: 0001948 białko wiążące ; • ligazy Aktywność ; • protein fosforylacji aminową wiążącego kwas ; • Aktywność dimeryzacji ; • p-kateniny wiązania ; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 ubikwityny proteiny ligazy aktywności ; • białkowa ubikwityny aktywności transferazy ; • wiązanie snoRNA;
Składnik komórkowy	• jądro ; • cytoplazma ; • nukleoplazmą ; • cytosolu ; • SCF ligazy ubikwityny kompleks ; • mała podjednostka processome ; • zawierający Pwp2p-subcomplex z 90S preribosome;
Proces biologiczny	• odpowiedź komórkowa na organiczny związek cykliczny ; • destabilizacja białek ; • regulacja cyklu komórkowego ; • proces kataboliczny białek ; • przejście G2/M w mitotycznym cyklu komórkowym ; • negatywna regulacja aktywności czynnika transkrypcyjnego wiążącego DNA ; • regulacja sygnalizacji kinazy I-kappaB/NF-kappaB ; • kaskada MAPK aktywowana stresem ; • ujemna regulacja transkrypcji, opartej na matrycy DNA ; • pozytywna regulacja proteolizy ; • regulacja procesu katabolicznego białek proteasomów ; • regulacja rytmu okołodobowego ; • proliferacja komórek nabłonka gruczołu sutkowego ; • rozgałęzienia zaangażowane w morfogenezę przewodu sutkowego ; • ujemna regulacja wygładzonej sygnalizacji szlaku ; • Sposób rytmiczne ; • sygnalizacji NIK / NF-kappaB ; • sygnału transdukcji ; • zależny od ubikwityny proces katabolicznym białko ; • regulacja kanonicznej Wnt szlak sygnalizacji ; • białka defosforylacja ; • dodatnia regulacja transkrypcji DNA na matrycy ; • ubikwitynacja białek ; • pozytywnej regulacji rytmu okołodobowego rytm ; • szlak sygnałowy Wnt ; • białko poliubikwitynacja ; • proces wirusowy GO:0022415 ; • posttranslacyjna modyfikacja białek ; • zależny od SCF proces kataboliczny białka zależny od ubikwityny proteasomów • szlak sygnałowy, w którym pośredniczy interleukina-1 ; • proces kataboliczny zależny od ubikwityny zależny od proteasomów • dojrzewanie SSU-rRNA z tricistronu Transkrypt rRNA (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • regulacja przejścia fazowego mitotycznego cyklu komórkowego • stymulujący szlak sygnałowy receptora lektyny typu C • szlak sygnałowy receptora Fc-epsilon • szlak sygnałowy receptora komórek T; ; ; ; ; ; ;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	8945
	12234
	ENSG00000166167
	ENSMUSG00000025217
	Q9Y297 ; Q5T1W7
	Q3ULA2
	NM_001256856 ; NM_003939 ; NM_033637
NM_001037758 ; NM_001286465 ; NM_001286466 ; NM_009771 ; NM_001360120;
	NM_001360122 ; NM_001360124 ; NM_001360126 ; NM_001360127
	NP_001243785 ; NP_003930 ; NP_378663
NP_001032847 ; NP_001273394 ; NP_001273395 ; NP_033901 ; NP_001347049;
	NP_001347051 ; NP_001347053 ; NP_001347055 ; NP_001347056
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

F-box / koła zawierający powtórzenie białka 1A (FBXW1A), znany również jako βTrCP1 lub Fbxw1 lub hsSlimb albo podjednostki receptora pIkappaBalpha E3 jest białkiem , które u ludzi jest kodowany przez BTRC (powtórz beta transducyna zawierającej) genu .

Gen ten koduje członka rodziny białek F-box, który charakteryzuje się około 40-resztowym motywem strukturalnym F-box. Białka F-box stanowią jedną z czterech podjednostek kompleksu ligazy białkowej ubikwityny zwanych SCF ( białko Skp1-Cul1-F-box ), które często, choć nie zawsze, rozpoznają substraty w sposób zależny od fosforylacji. Białka F-box dzielą się na 3 klasy:

Fbxws zawierające powtórzenia WD40 ,
Fbxls zawierające powtórzenia bogate w leucynę ,
i Fbxos zawierające albo „inne” moduły interakcji białko-białko, albo bez rozpoznawalnych motywów.

Białko kodowane przez ten gen należy do klasy Fbxw, ponieważ oprócz F-box zawiera wiele powtórzeń WD40. Białko to jest homologiczne do Xenopus βTrCP, drożdży Met30 , Neurospora Scon2 i Drosophila Slimb . U ssaków oprócz βTrCP1 występuje również białko paralogu (nazywane βTrCP2 lub FBXW11 ), ale jak dotąd ich funkcje wydają się zbędne i nie do odróżnienia.

Odkrycie

Ludzkie βTrCP (określane zarówno jako βTrCP1 jak i βTrCP2) zostało pierwotnie zidentyfikowane jako komórkowa ligaza ubikwityny, która jest wiązana przez białko wirusa Vpu HIV-1 w celu wyeliminowania komórkowego CD4 przez połączenie go z maszynerią proteolityczną. Następnie wykazano, że βTrCP reguluje wiele procesów komórkowych poprzez pośredniczenie w degradacji różnych celów. Regulatory cyklu komórkowego stanowią główną grupę substratów βTrCP. Podczas fazy S, βTrCP utrzymuje CDK1 w ryzach poprzez promowanie degradacji fosfatazy CDC25A, podczas gdy w G2, βTrCP przyczynia się do aktywacji CDK1 poprzez kierowanie kinazy WEE1 do degradacji. We wczesnej mitozie βTrCP pośredniczy w degradacji EMI1, inhibitora kompleksu ligazy ubikwityny APC/C , który jest odpowiedzialny za przejście anafaza-metafaza (poprzez indukowanie proteolizy Securin) i wyjście mitotyczne (poprzez napędzanie degradacji mitotycznego CDK1 aktywacja podjednostek cyklin). Co więcej, βTrCP kontroluje APC/C poprzez celowanie w REST, usuwając w ten sposób jego represję transkrypcyjną na MAD2, niezbędny składnik punktu kontrolnego składania wrzeciona, który utrzymuje APC/C w stanie nieaktywnym, dopóki wszystkie chromatydy nie zostaną przyłączone do mikrotubul wrzeciona.

Funkcjonować

βTrCP odgrywa ważną rolę w regulacji punktów kontrolnych cyklu komórkowego. W odpowiedzi na stres genotoksyczny przyczynia się do wyłączenia aktywności CDK1, pośrednicząc w degradacji CDC25A we współpracy z Chk1, zapobiegając w ten sposób progresji cyklu komórkowego przed zakończeniem naprawy DNA. Podczas odzyskiwania po replikacji DNA i uszkodzenia DNA, βTrCP zamiast tego celuje w Claspin w sposób zależny od Plk1.

βTrCP okazał się również ważnym graczem w translacji białek, wzroście i przeżyciu komórek. W odpowiedzi na mitogeny, PDCD4, inhibitor czynnika inicjacji translacji eIF4A, ulega szybkiej degradacji w sposób zależny od βTrCP i S6K1, umożliwiając wydajną translację białka i wzrost komórek. Innym celem βTrCP, który jest zaangażowany w translację białka, jest eEF2K, który hamuje wydłużenie translacji poprzez fosforylację eukariotycznego czynnika elongacji 2 (eEF2) i zmniejszanie jego powinowactwa do rybosomu. βTrCP współpracuje również z mTOR i CK1α, indukując degradację DEPTOR (inhibitor mTOR), tworząc w ten sposób pętlę autoamplifikacji, aby promować pełną aktywację mTOR. W tym samym czasie βTrCP pośredniczy w degradacji proapoptotycznego białka BimEL w celu promowania przeżycia komórek.

βTrCP wiąże się również z ufosforylowanymi motywami niszczenia IkappaBalpha i beta-kateniny , prawdopodobnie funkcjonując w wielu programach transkrypcyjnych poprzez regulację szlaków NF-kappaB i WNT . Wykazano również, że βTrCP reguluje odłączenie centrioli i licencjonowanie. βTrCP celuje w międzycentrosomalne białko łącznikowe Cep68 w prometafazie, co przyczynia się do rozerwania centrioli i późniejszego oddzielenia centrioli.

Interakcje

Wykazano, że BTRC (gen) wchodzi w interakcje z:

C22orf25

Znaczenie kliniczne

βTrCP zachowuje się w niektórych tkankach jak onkoproteina. Podwyższone poziomy ekspresji βTrCP stwierdzono w raku jelita grubego, trzustki, guza zarodkowego i piersi.

Bibliografia

Zewnętrzne linki

Lokalizacja ludzkiego genomu BTRC i strona szczegółów genu BTRC w przeglądarce genomu UCSC .

Dalsza lektura

Westbrook TF, Hu G, Ang XL, Mulligan P, Pavlova NN, Liang A, Leng Y, Maehr R, Shi Y, Harper JW, Elledge SJ (marzec 2008). „SCFbeta-TRCP kontroluje transformację onkogenną i różnicowanie neuronalne poprzez degradację REST” . Natura . 452 (7185): 370-4. Kod Bib : 2008Natur.452..370W . doi : 10.1038/nature06780 . PMC 2688689 . PMID 18354483 .
Maniatis T (marzec 1999). „Kompleks ligazy ubikwitynowej niezbędny dla szlaków sygnałowych NF-kappaB, Wnt/Wingless i Hedgehog” . Geny i rozwój . 13 (5): 505–10. doi : 10.1101/gad.13.5.505 . PMID 10072378 .
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). „Rola białek pomocniczych HIV-1 w patogenezie wirusów i oddziaływaniach gospodarz-patogen” . Badania komórek . 15 (11-12): 923-34. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (wrzesień 1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrycie genów” . Badania genomu . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Yaron A, Hatzubai A, Davis M, Lavon I, Amit S, Manning AM, Andersen JS, Mann M, Mercurio F, Ben-Neriah Y (grudzień 1998). „Identyfikacja składnika receptora ligazy IkappaBalpha-ubikwityny”. Natura . 396 (6711): 590-4. Kod Bib : 1998Natur.396..590Y . doi : 10.1038/25159 . PMID 9859996 . S2CID 4408963 .
Winston JT, Strack P, Beer-Romero P, Chu CY, Elledge SJ, Harper JW (luty 1999). „Kompleks ligazy SCFbeta-TRCP-ubikwityny łączy się specyficznie z fosforylowanymi motywami niszczenia w IkappaBalpha i beta-kateninie i stymuluje ubikwitynację IkappaBalpha in vitro” . Geny i rozwój . 13 (3): 270–83. doi : 10.1101/gad.13.3.270 . PMC 316433 . PMID 9990852 .
Spencer E, Jiang J, Chen ZJ (luty 1999). „Indukowana sygnałem ubikwitynacja IkappaBalpha przez białko F-box Slimb/beta-TrCP” . Geny i rozwój . 13 (3): 284–94. doi : 10.1101/gad.13.3.284 . PMC 316434 . PMID 9990853 .
Kitagawa M, Hatakeyama S, Shirane M, Matsumoto M, Ishida N, Hattori K, Nakamichi I, Kikuchi A, Nakayama K, Nakayama K (maj 1999). „Białko F-box, FWD1, pośredniczy w proteolizie zależnej od ubikwityny beta-kateniny” . Dziennik EMBO . 18 (9): 2401–10. doi : 10.1093/emboj/18.9.2401 . PMC 1171323 . PMID 10228155 .
Wu C, Ghosh S (październik 1999). „beta-TrCP pośredniczy w indukowanej sygnałem ubikwitynacji IkappaBbeta” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 274 (42): 29591-4. doi : 10.1074/jbc.274.42.29591 . PMID 10514424 .
Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (październik 1999). „Identyfikacja rodziny ludzkich białek F-box” . Aktualna Biologia . 9 (20): 1177-9. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID 10531035 . S2CID 7467493 .
Stone DM, Murone M, Luoh S, Ye W, Armanini MP, Gurney A, Phillips H, Brush J, Goddard A, de Sauvage FJ, Rosenthal A (grudzień 1999). „Charakterystyka ludzkiego supresora fuzji, negatywnego regulatora czynnika transkrypcji palca cynkowego Gli”. Journal of Cell Science . 112. 112 ( Pt 23) (23): 4437-48. doi : 10.1242/jcs.112.23.4437 . PMID 10564661 .
Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (styczeń 2000). „Homodimer dwóch białek F-box betaTrCP1 lub betaTrCP2 wiąże się z IkappaBalpha dla zależnej od sygnału ubikwitynacji” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 275 (4): 2877-84. doi : 10.1074/jbc.275.4.2877 . PMID 10644755 .
Przeczytaj MA, Brownell JE, Gladysheva TB, Hottelet M, Parent LA, Coggins MB, Pierce JW, Podust VN, Luo RS, Chau V, Palombella VJ (kwiecień 2000). „Modyfikacja Nedd8 cul-1 aktywuje zależną od SCF(beta(TrCP)) ubikwitynację IkappaBalpha” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (7): 2326–33. doi : 10.1128/MCB.20.7.2326-2333.2000 . PMC 85397 . PMID 10713156 .
Sadot E, Simcha I, Iwai K, Ciechanover A, Geiger B, Ben Ze'ev A (kwiecień 2000). „Różnicowe oddziaływanie plakoglobiny i beta-kateniny z układem ubikwityna-proteasom” . Onkogen . 19 (16): 1992-2001. doi : 10.1038/sj.onc.1203519 . PMID 10803460 .
Chiaur DS, Murthy S, Cenciarelli C, Parks W, Loda M, Inghirami G, Demetrick D, Pagano M (2000). „Pięć ludzkich genów kodujących białka F-box: mapowanie i analiza chromosomów w ludzkich nowotworach”. Cytogenetyka i Genetyka Komórkowa . 88 (3-4): 255-8. doi : 10.1159/000015532 . PMID 10828603 . S2CID 431704 .
Orian A, Gonen H, Bercovich B, Fajerman I, Eytan E, Izrael A, Mercurio F, Iwai K, Schwartz AL, Ciechanover A (czerwiec 2000). „Przetwarzanie NF-kappaB p105 za pośrednictwem ligazy ubikwitynowej SCF(beta)(-TrCP) wymaga fosforylacji jego C-końca przez kinazę IkappaB” . Dziennik EMBO . 19 (11): 2580–91. doi : 10.1093/emboj/19.11.2580 . PMC 212749 . PMID 10835356 .
Strack P, Caligiuri M, Pelletier M, Boisclair M, Theodoras A, Beer-Romero P, Szkło S, Parsons T, Copeland RA, Auger KR, Benfield P, Brizuela L, Rolfe M (lipiec 2000). „SCF(beta-TRCP) i ubikwitynacja zależna od fosforylacji I kappa B alfa katalizowana przez Ubc3 i Ubc4” . Onkogen . 19 (31): 3529-36. doi : 10.1038/sj.onc.1203647 . PMID 10918611 .
Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, Gill G, Howley PM (sierpień 2000). „Białka hPLIC mogą zapewniać połączenie między maszynerią ubikwitynacji a proteasomem” . Komórka molekularna . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00040-X . PMID 10983987 .

Languages

In other projects