MYB (gen) - MYB (gene)
| Myb-podobna domena wiążąca DNA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | Wiązanie Myb_DNA | ||||||||
| Pfam | PF00249 | ||||||||
| InterPro | IPR001005 | ||||||||
| CAT | 1irz | ||||||||
| SCOP2 | 1irz / zakres / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00167 | ||||||||
| |||||||||
MYB genów należą do dużej rodziny genów do czynników transkrypcyjnych u zwierząt i roślin. U ludzi zawiera protoonkogen Myb, taki jak 1 i białko B związane z Myb, oprócz właściwego MYB . Członkowie rozszerzonej rodziny SANT/Myb obejmują również domenę SANT i inne podobne, całkowicie helikalne domeny przypominające homeobox .
Funkcjonować
Wirusowy
Rodzina genów Myb pochodzi od tytułowego genu wirusa ptasiej mieloblastozy . Wirusowy Myb (V-Myb, P01104 ) rozpoznaje sekwencję 5'- T AAC K G-3' . Powoduje mieloblastozę (białaczkę szpikową) u kur. W porównaniu z normalnym zwierzęcym Myb komórkowym (c-myb), v-myb zawiera delecje w C-końcowej domenie regulatorowej, co prowadzi do nieprawidłowej aktywacji innych onkogenów.
Zwierząt
Białka MYB protoonkogenu jest członkiem MYB ( my elo b lastosis) rodziny czynników transkrypcyjnych . Białko zawiera trzy domeny, N-końcową domenę wiążącą DNA , centralną domenę aktywacji transkrypcji i C-końcową domenę zaangażowaną w represję transkrypcji . Może odgrywać rolę w regulacji cyklu komórkowego. Podobnie jak wersja wirusowa, ten gen jest onkogenem , a rearanżacje genu (często obejmujące delecję w domenie C-końcowej) powodują raka.
Rośliny
Czynniki MYB reprezentują rodzinę białek, która obejmuje konserwatywną domenę wiążącą DNA MYB. Rośliny zawierają podrodzinę białka MYB, która charakteryzuje się domeną MYB typu R2R3.
W kukurydzy flobafeny są syntetyzowane w szlaku syntezy flawonoidów z polimeryzacji flawan-4-oli, które kodują aktywator transkrypcyjny podobny do myb R2R3 genu A1 kodującego 4-reduktazę dihydroflawonolu (redukcja dihydroflawonoli do flawan-4-oli), podczas gdy inny gen (Suppressor of Pericarp Pigmentation 1 lub SPP1) działa jako supresor . Gen P kukurydzy koduje homolog Myb, który rozpoznaje sekwencję CCWACC, w ostrym kontraście z YAACGG związanym przez białka Myb kręgowców.
W sorgo odpowiada żółty nasion jeden gen (Y1) również koduje typ R2R3 białka domeny MYB, który reguluje ekspresję chalkonu syntazy , chalkonu izomerazy i dihydroflawonolu reduktazy genów wymaganych do biosyntezy 3-deoxyflavonoids .
Ruby jest aktywatorem transkrypcji MYB genów wytwarzających antocyjany w owocach cytrusowych. W większości odmian cytrusów rubin jest niefunkcjonalny, ale w czerwonych pomarańczach zwiększa produkcję antocyjanów, aby uzyskać charakterystyczny czerwony kolor owocu.
Zobacz też
Bibliografia
Dalsza lektura
- O IH, Reddy EP (1999). „Rodzina genów myb we wzroście, różnicowaniu i apoptozie komórek” . Onkogen . 18 (19): 3017-33. doi : 10.1038/sj.onc.1202839 . PMID 10378697 .
- Nicolaides NC, Gualdi R, Casadevall C, Manzella L, Calabretta B (1991). „Dodatnia autoregulacja ekspresji c-myb przez miejsca wiązania Myb w regionie flankującym 5' ludzkiego genu c-myb” . Mol. Komórka. Biol . 11 (12): 6166–76. doi : 10.1128/mcb.11.12.6166 . PMC 361795 . PMID 1944282 .
- Kalkbrenner F, Guehmann S, Moelling K (1990). „Aktywacja transkrypcyjna przez ludzkie geny c-myb i v-myb”. Onkogen . 5 (5): 657–61. PMID 2189102 .
- Westin EH, Gorse KM, Clarke MF (1990). „Alternatywne składanie ludzkiego genu c-myb”. Onkogen . 5 (8): 1117-24. PMID 2202948 .
- Dasgupta P, Reddy EP (1990). „Identyfikacja alternatywnie składanych transkryptów dla ludzkiego c-myb: klonowanie molekularne i analiza sekwencji ludzkich sekwencji c-myb eksonu 9A”. Onkogen . 4 (12): 1419–23. PMID 2687764 .
- Janssen JW, Vernole P, de Boer PA, Oosterhuis JW, Collard JG (1986). „Sublokalizacja c-myb do 6q21 ---- q23 przez hybrydyzację in situ i ekspresję c-myb w ludzkim potworniaku z przegrupowaniami 6q”. Cytogenet. Genetyka komórki . 41 (3): 129–35. doi : 10.1159/000132217 . PMID 3007038 .
- Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Keith DE, Prasa MF, Larson RA, Souza LM (1986). „Badania ludzkiego genu c-myb i jego produktu w ludzkich ostrych białaczkach”. Nauka . 233 (4761): 347-51. Kod Bibcode : 1986Sci...233..347S . doi : 10.1126/science.3014652 . PMID 3014652 .
- Majello B, Kenyon LC, Dalla-Favera R (1987). „Ludzki protoonkogen c-myb: sekwencja nukleotydowa cDNA i organizacja locus genomowego” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 83 (24): 9636-40. doi : 10.1073/pnas.83.24.9636 . PMC 387195 . PMID 3540945 .
- Szczylik C, Skorski T, Ku DH, Nicolaides NC, Wen SC, Rudnicka L, Bonati A, Malaguarnera L, Calabretta B (1993). „Regulacja proliferacji i ekspresji cytokin fibroblastów szpiku kostnego: rola c-myb” . J. Eksp. Med . 178 (3): 997–1005. doi : 10.1084/jem.178.3.997 . PMC 2191153 . PMID 7688794 .
- Krieg J, Oelgeschläger M, Janknecht R, Lüscher B (1995). „Wysokie powinowactwo wiązania DNA natywnej pełnej długości c-Myb i różnicowej wrażliwości proteolitycznej jego domen N- i C-końcowych”. Onkogen . 10 (11): 2221-8. PMID 7784067 .
- Jacobs SM, Gorse KM, Westin EH (1994). „Identyfikacja drugiego promotora w ludzkim protoonkogenie c-myb”. Onkogen . 9 (1): 227–35. PMID 8302584 .
- Favier D, Gonda TJ (1994). „Wykrywanie białek, które wiążą się z motywem suwaka leucynowego c-Myb”. Onkogen . 9 (1): 305-11. PMID 8302594 .
- Glaser R, Lafuse WP, Bonneau RH, Atkinson C, Kiecolt-Glaser JK (1993). „Związana ze stresem modulacja ekspresji protoonkogenów w ludzkich leukocytach krwi obwodowej”. Zachowuj się. Neurosci . 107 (3): 525-9. doi : 10.1037/0735-7044.107.3.525 . PMID 8329139 .
- Dash AB, Orrico FC, Ness SA (1996). „Motyw EVES pośredniczy w regulacji międzycząsteczkowej i wewnątrzcząsteczkowej c-Myb” . Geny Dev . 10 (15): 1858–69. doi : 10.1101/gad.10.15.1858 . PMID 8756344 .
- Vorbrueggen G, Lovrić J, Moelling K (1997). „Funkcjonalna analiza fosforylacji w serynie 532 ludzkiego c-Myb przez kinazę MAP”. Biol. Chem . 377 (11): 721–30. doi : 10.1515/bchm3.1996.377.11.721 . PMID 8960373 .
- Tavner FJ, Simpson R, Tashiro S, Favier D, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Macmillan EM, Lutwyche J, Keough RA, Ishii S, Gonda TJ (1998). „Klonowanie molekularne ujawnia, że białko wiążące p160 Myb jest nowym, głównie jąderkowym białkiem, które może odgrywać rolę w transaktywacji przez Myb” . Mol. Komórka. Biol . 18 (2): 989–1002. doi : 10.1128/MCB.18.2.989 . PMC 108811 . PMID 9447996 .
- Hedge SP, Kumar A, Kurschner C, Shapiro LH (1998). „c-Maf oddziałuje z c-Myb w celu regulacji transkrypcji wczesnego genu mieloidalnego podczas różnicowania” . Mol. Komórka. Biol . 18 (5): 2729–37. doi : 10.1128/mcb.18.5.2729 . PMC 110652 . PMID 9566892 .
- Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (1998). „Kinaza Pim-1 i p100 współpracują w celu zwiększenia aktywności c-Myb” . Mol. Komórka . 2 (4): 417–25. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80141-0 . PMID 9809063 .
- Thompson MA, Rosenthal MA, Ellis SL, Przyjaciel AJ, Zorbas MI, Whitehead RH, Ramsay RG (1998). „Regulacja w dół c-Myb jest związana z różnicowaniem ludzkich komórek okrężnicy, apoptozą i zmniejszoną ekspresją Bcl-2”. Cancer Res . 58 (22): 5168–75. PMID 9823328 .
- Verbeek W, Gombart AF, Chumakov AM, Müller C, Friedman AD, Koeffler HP (1999). „C/EBPepsilon bezpośrednio oddziałuje z domeną wiążącą DNA c-myb i wspólnie aktywuje transkrypcję promotorów szpiku” . Krew . 93 (10): 3327–37. doi : 10.1182/krew.V93.10.3327 . PMID 10233885 .
Zewnętrzne linki
- MYB+białko,+człowiek w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)
- Drosophila Myb onkogenopodobny - Interaktywna mucha
- Rodzina Arabidospsis thaliana MYB w bazie danych czynników transkrypcyjnych Arabidopsis (DATF)
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .