HLA-DRB1 - HLA-DRB1
Antygenów zgodności tkankowej klasy II HLA, łańcuch beta-DRB 1 to białka , które dla ludzi są kodowane przez HLA-DRB1 genu . DRB1 koduje najbardziej rozpowszechnioną podjednostkę beta HLA-DR . Allele DRB1, zwłaszcza te kodujące zmiany sekwencji aminokwasowej w pozycjach 11 i 13, są związane z ryzykiem reumatoidalnego zapalenia stawów .
Funkcjonować
Białko kodowane przez ten gen należy do HLA klasy II łańcucha beta paralogues . Cząsteczka klasy II jest heterodimerem składającym się z łańcucha alfa (DRA) i beta (DRB), oba zakotwiczone w błonie. Odgrywa centralną rolę w układzie odpornościowym, prezentując peptydy pochodzące z białek zewnątrzkomórkowych limfocytom T pomocniczym . Cząsteczki klasy II ulegają konstytutywnej ekspresji w profesjonalnych komórkach prezentujących antygen (limfocyty APC: B, komórki dendrytyczne, makrofagi) i mogą być indukowane w nieprofesjonalnych APC.
Istnieją dowody, że jest to związane ze zmniejszonym nasileniem choroby COVID-19.
Struktura genów i polimorfizmy
Łańcuch beta ma około 26-28 kDa. Jest kodowany przez 6 egzonów , ekson pierwszy koduje peptyd liderowy, eksony 2 i 3 kodują dwie domeny zewnątrzkomórkowe , ekson 4 koduje domenę transbłonową, a ekson 5 koduje ogon cytoplazmatyczny . W obrębie cząsteczki DR łańcuch beta zawiera wszystkie polimorfizmy określające swoistość wiązania peptydu. Opisano setki alleli DRB1, a typowanie tych polimorfizmów jest rutynowo wykonywane w przypadku przeszczepu szpiku kostnego i nerki.
Ekspresja genu
DRB1 jest wyrażany na poziomie pięć razy wyższym niż jego paralogi DRB3 , DRB4 i DRB5 . DRB1 jest obecny u wszystkich osobników. Warianty alleliczne DRB1 są połączone z żadnym lub jednym z genów DRB3, DRB4 i DRB5. Istnieje 5 powiązanych pseudogenów: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 i DRB9.
Częstość występowania allelu HLA-DRB1*10:01 znacznie wzrosła u osób z chorobą anty-IgLON5 .
Zobacz też
Bibliografia
Dalsza lektura
- Turesson C, Matteson EL (styczeń 2006). „Genetyka reumatoidalnego zapalenia stawów”. Postępowanie w klinice Mayo . 81 (1): 94-101. doi : 10.4065/81.1.94 . PMID 16438485 .
- Ahmad T, Marshall SE, Jewell D (czerwiec 2006). „Genetyka nieswoistego zapalenia jelit: rola kompleksu HLA” . Światowy Dziennik Gastroenterologii . 12 (23): 3628-35. doi : 10.3748/wjg.v12.i23.3628 . PMC 4087453 . PMID 16773677 .
- Schmidt H, Williamson D, Ashley-Koch A (maj 2007). "HLA-DR15 haplotyp i stwardnienie rozsiane: ogromny przegląd" . American Journal of Epidemiology . 165 (10): 1097–109. doi : 10.1093/aje/kwk118 . PMID 17329717 .