Doszło do poważnych zakłóceń w formacie mistrzostw 1941 z powodu poważnego wybuchu pryszczycy w wielu częściach Munsteru i południowego Leinster . Mistrzostwa odbyły się jak zwykle na zasadzie pucharowej prowincji; jednak, aby poradzić sobie z tą sytuacją, trzeba było dokonać pewnych poprawek. Na przykład Dublin nie wziął udziału w półfinale All-Irlandia jako mistrz Leinster; zostali nominowani do gry, a ich finał Leinster przeciwko Carlow (który wygrał Dublin) został przełożony na listopad.
Zmiana formatu Munster Championship
Kerry , drużyna pożegnalna do finału w Munster, Cork drużyna pożegnalna do półfinału w Munster. W rundzie wstępnej rozegrano pojedynek pomiędzy Tipperary i Waterford – zwycięzcy otrzymali ćwierćfinał przeciwko Clare . Limerick odmówił udziału w mistrzostwach. Był również używany w mistrzostwach w 1939 roku, ale ten format nie istniał ponownie do 1980 roku.
Powtórka półfinału z 1941 roku, która odbyła się w Tralee , była ostatnią powtórką półfinałową w całej Irlandii, która odbyła się poza Croke Park aż do powtórki z 1983 roku pomiędzy Cork i Dublinem w Páirc Uí Chaoimh .
Niektóre gry były dotknięte problemami z pryszczycą i ustami. Oznaczało to, że mecz Tipperary vs Clare przyznano Clare bez udziału i tylko co najmniej 25 zamiast zwykłych 31-32 drużyn wzięło udział w mistrzostwach.
Kerry wygrał po raz drugi w historii trzy razy z rzędu jako All Ireland Champions, dając w sumie 15 tytułów najwięcej w ciągu roku.