Salmonella enterica subsp. jelitowa -Salmonella enterica subsp. enterica
Salmonella enterica subsp. enterica | |
---|---|
Kolonie Salmonella Typhimurium na płytce z agarem jelitowym Hektoen | |
Klasyfikacja naukowa | |
Domena: | Bakteria |
Gromada: | Proteobakterie |
Klasa: | Gammaproteobakterie |
Zamówienie: | Enterobakterie |
Rodzina: | Enterobacteriaceae |
Rodzaj: | Salmonella |
Gatunek: | |
Podgatunki: |
S. e. subsp. enterica
|
Nazwa trójmianowa | |
Salmonella enterica subsp. enterica |
Salmonella enterica subsp. enterica jest A podgatunków z Salmonella enterica , w kształcie pręta, flagellated , tlenowym, Gram-ujemnych bakterii . Wiele chorobotwórczych serotypów zgatunku S. enterica należy do tego podgatunku, w tym odpowiedzialnego za dur brzuszny .
Serowary
S. enterica subsp. enterica zawiera dużą liczbę serotypów, które mogą infekować szeroką gamę żywicieli kręgowców . Poszczególni członkowie wahają się od wysoce przystosowanych do gospodarza (zdolnych tylko do infekowania wąskiego zakresu gatunków) do wykazywania szerokiego zakresu żywicieli. Obecnie do rozróżniania serotypów stosuje się szereg technik . Obejmują one poszukiwanie obecności lub nieobecności antygenów , typowanie fagowe , molekularne odciski palców i biotypowanie, gdzie serotypy są różnicowane na podstawie tego, jakie składniki odżywcze są w stanie fermentować. Możliwym czynnikiem określającym zakres gospodarzy poszczególnych serotypów jest fagowe pozyskiwanie niewielkiej liczby elementów genetycznych, które umożliwiają infekcję określonego gospodarza. Ponadto postuluje się, że serotypy, które infekują wąski zakres gatunków, oddzieliły się od przodków o szerokim zakresie gospodarzy i od tego czasu wyspecjalizowały się i utraciły zdolność do infekowania niektórych żywicieli.
Wybór serotypów z wymienionymi znanymi gospodarzami. Ponieważ istnieje ponad 2500 serotypów Salmonella enterica subsp. enterica , ta lista jest niekompletna.
Serowar | Gatunki żywicielskie |
---|---|
Salmonella Choleraesuis | Wieprz |
Salmonella w Dublinie | Bydło |
Salmonella Enteritidis | Ludzie, gryzonie, Galliformes |
Salmonella Gallinarum | Galliformes |
Salmonella Hadar | Ludzie, Galliformes, króliki |
Salmonella Heidelberg | Ludzie, Galliformes, świnie |
Salmonella Infantis | Ludzie, drób |
Salmonella Paratyphi | Ludzie |
Salmonella Typhi | Ludzie |
Salmonella typhimurium | Ludzie, bydło, świnie, owce, konie, gryzonie, Galliformes |
Badanie danych z 37 krajów zebranych w latach 2001-2007 wykazało, że najczęstszym serowarem Salmonelli wyizolowanym z przypadków u ludzi był Enteritidis, wykryty średnio w 43,5% przypadków, a następnie Typhimurium (17,1% przypadków), Newport (3,5 %), Infantis (1,8%), Virchow (1,5%), Hadar (1,5%) i Agona (0,8%).
Jednym ze szczepów Salmonelli, który pojawił się ostatnio w Stanach Zjednoczonych, jest S. enterica ser. Javiana. „Wybuch epidemii miał miejsce w 2002 roku, było 141 przypadków, które wystąpiły wśród uczestników amerykańskich Igrzysk Transplantacyjnych. Spośród 141 przypadków większość przypadków dotyczyła biorców przeszczepów (34%) lub osób otrzymujących terapię immunosupresyjną (32%)” . Istnieje coraz większa liczba serotypów Salmonella, które są wielolekooporne (MDR), które zostały zidentyfikowane przez Krajowy System Monitorowania Oporności Przeciwdrobnoustrojowej CDC . „ Salmonella Javiana [ sic ] jest przyczyną 4% nietypowych zakażeń Salmonellą w Stanach Zjednoczonych każdego roku”.
W listopadzie 2016 r. w Pakistanie, głównie z miast Hyderabad i Karaczi, pojawił się nowy szczep wysoce lekoopornej (XDR) Salmonella enterica Typhi . Szczepy wielolekooporne są obecne od późnych lat 70. w Afryce i Azji. Te szczepy XDR są oporne na wszystkie opcje leczenia antybiotykami: chloramfenikol , ampicylinę , trimetoprim-sulfametoksazol , fluorochinolony i cefalosporyny trzeciej generacji . Epidemia trwa od 2016 roku.
Metabolizm
Dowody genetyczne sugerują, że serotypy można podzielić na dwie grupy – jedną, która powoduje infekcje jelitowe i ma szeroki repertuar zdolności metabolicznych, oraz drugą, która zwykle powoduje infekcję inwazyjną, często w wąskim zakresie gospodarzy i wykazuje degradację beztlenowych szlaków metabolicznych . Uważa się, że te zdolności metaboliczne są ważne dla uzyskania składników odżywczych w trudnym i ograniczonym do składników odżywczych środowisku stanu zapalnego jelit.
Nomenklatura
Serotypy mogą być oznaczone w całości lub w skróconej formie. W krótkiej formie wymieniono rodzaj Salmonella , po którym następuje serotyp pisany z dużej litery , np. Salmonella Typhi, podczas gdy pełne oznaczenie Salmonella Typhi to Salmonella enterica subsp. enterica serowar Typhi. Każdy serovar może mieć również wiele szczepów, co pozwala na szybki wzrost całkowitej liczby bakterii zmiennych antygenowo .
Epidemiologia
Inwazyjne szczepy nietyfusowej Salmonelli , takie jak Salmonella Typhimurium ST313, zostały ostatnio oznaczone jako powodujące pojawiające się choroby w Afryce. Kluczowe niedobory odporności gospodarzy związane z HIV , malarią i niedożywieniem przyczyniły się do szerokiego rozprzestrzeniania się tej choroby i konieczności stosowania drogich leków przeciwdrobnoustrojowych w najbiedniejszych służbach zdrowia na świecie. Wykazano jednak, że również czynniki bakteryjne, takie jak zwiększona aktywność genu wirulencji pgtE , ze względu na polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) w jego regionie promotorowym, mają duży wpływ na patogenezę tego konkretnego typu sekwencji Salmonelli .