Fitoreowirus - Phytoreovirus
| Fitoreowirusy | |
|---|---|
|
|
| Cryo-EM struktury białka kapsydu wirusa karłowatości ryżu (RDV) | |
Klasyfikacja wirusów 
|
|
| (nierankingowe): | Wirus |
| Dziedzina : | Riboviria |
| Królestwo: | Orthornavirae |
| Gromada: | Duplornaviricota |
| Klasa: | Resentoviricetes |
| Zamówienie: | Reovirales |
| Rodzina: | Reoviridae |
| Podrodzina: | Sedoreovirinae |
| Rodzaj: | Fitoreowirusy |
Fitoreowirus to rodzaj wirusów z rodziny Reoviridae , z podrodziny Sedoreovirinae . Są to reowirusy, które nie występują w turretach, które są głównymi patogenami rolniczymi, szczególnie w Azji . Oryza sativa dla RDV i RGDV, rośliny dwuliścienne dla WTV i skoczkowate służą jako naturalni żywiciele. W tym rodzaju są trzy gatunki. Choroby związane z tym rodzajem obejmują: WTV: galasy (guz). RDV: choroba karłowata (lub karłowata) ryżu. RGDV: karłowatość, karłowatość i galasy.
Klasyfikacja
Jeden z członków tej rodziny, wirus karłowatości ryżu (RDV), był szeroko badany za pomocą kriomikroskopii elektronowej i krystalografii rentgenowskiej . Na podstawie tych analiz wyprowadzono modele atomowe białek kapsydu i prawdopodobny model składania kapsydu. Podczas gdy białka strukturalne RDV nie mają podobieństwa sekwencji do innych białek, ich fałdy i ogólna struktura kapsydu są podobne do tych z innych reowirusów.
Fitoreowirusy są wyjątkowe wśród reowirusów, ponieważ w każdym wirusie znajduje się 12 segmentów dsRNA. Podobnie jak wszystkie inne reowirusy, zawierają one własną polimerazę RNA zależną od RNA , umożliwiając endogenną syntezę wirusowego mRNA w obrębie wirusa. Chociaż mniej dobrze zbadane niż ortoreowirusy i orbiwirusy , podjęto znaczące badania strukturalne i biochemiczne w celu scharakteryzowania fitoreowirusów, które na ogół infekują rośliny. Istnieją trzy rozpoznane fitoreowirusy: wirus nowotworu rany (WTV), wirus karłowatości ryżu (RDV) i wirus karłowatości żółci ryżu (RGDV). Możliwymi dodatkowymi członkami rodziny są wirus liścia tytoniu (TLEF), wirus karłowatości pęczka ryżu i wirus słodkich ziemniaków (ICTV, VIDE). Istnieje również kilka izolatów RDV, z których wszystkie mają ponad 90% identyczności sekwencji. Spośród tych fitoreowirusów RDV był szeroko badany i jest najlepiej scharakteryzowanym członkiem. Większość naszej wiedzy na temat składania i struktury fitoreowirusów opiera się na danych strukturalnych zgromadzonych w badaniach RDV.
Taksonomia
Do rodzaju należą następujące trzy gatunki:
Struktura
Wirusy w Phytoreovirus nie mają otoczki, mają geometrię ikosaedryczną i symetrię T = 13, T = 2. Średnica wynosi około 70 nm. Genomy są liniowe i podzielone na segmenty. Segmenty mają rozmiar od 1066 do 4423 par zasad, co daje całkowitą długość genomu około 26 kb. Genom koduje 15 białek i ma 4 otwarte ramki odczytu.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Capsid | Układ genomowy | Segmentacja genomowa |
|---|---|---|---|---|---|
| Fitoreowirusy | Icosaedr | T = 13, T = 2 | Bez otoczki | Liniowy | Segmentowane |
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza następuje poprzez penetrację do komórki gospodarza. Replikacja przebiega według modelu replikacji wirusa dwuniciowego RNA. Transkrypcja dwuniciowego wirusa RNA jest metodą transkrypcji. Wirus opuszcza komórkę gospodarza na drodze jednoczęściowego, niezwiązanego z kanalikami ruchu wirusa. Naturalnym żywicielem jest Oryza sativa dla rdv i rgdv oraz dwuliścienna dla wtv. Wirus jest przenoszony za pośrednictwem wektora (mechaniczna inokulacja owadów w roślinie przez skoczki). Drogi transmisji są wektorowe i mechaniczne.
| Rodzaj | Szczegóły hosta | Tropizm tkankowy | Szczegóły wejścia | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Fitoreowirusy | Oryza sativa; skoczki liściowe | Łyko | Ruch wirusowy; zaszczepianie mechaniczne | Śmierć komórki | Cytoplazma | Cytoplazma | Skoczki liściowe |