Molekularna epidemiologia patologiczna - Molecular pathological epidemiology
Patologiczna epidemiologia molekularna ( MPE , także molekularna epidemiologia patologiczna ) jest dyscypliną łączącą epidemiologię i patologię . Definiuje się ją jako „epidemiologię patologii molekularnej i heterogeniczność choroby”. Patologia i epidemiologia mają ten sam cel, jakim jest wyjaśnienie etiologii choroby, a MPE dąży do osiągnięcia tego celu na poziomie molekularnym, indywidualnym i populacyjnym. Zazwyczaj MPE wykorzystuje zasoby patologii tkanek i dane w ramach istniejących badań epidemiologicznych. Epidemiologia molekularna szeroko obejmuje epidemiologię MPE oraz epidemiologię molekularną typu konwencjonalnego z wykorzystaniem tradycyjnych systemów oznaczania chorób.
Proces chorobowy
Dane z projektów The Cancer Genome Atlas wskazują, że ewolucja choroby jest z natury niejednorodnym procesem. Każdy pacjent ma unikalny proces chorobowy („unikalna zasada choroby”), biorąc pod uwagę unikalność eksposomu i jego unikalny wpływ na molekularny proces patologiczny. Koncepcja ta została przyjęta w medycynie klinicznej wraz z medycyną precyzyjną i medycyną spersonalizowaną .
Metodologia
W przypadku MPE badacze analizują współzależności między ekspozycjami (np. czynniki środowiskowe, dietetyczne, styl życia i genetyczne); zmiany w cząsteczkach komórkowych lub pozakomórkowych (podpisy molekularne choroby); oraz ewolucja i postęp choroby. Badacze mogą analizować genom , metylom , epigenom , metabolom , transkryptom , proteom , mikrobiom , odporność i interakcję . Przypuszczalny czynnik ryzyka można powiązać z określonymi sygnaturami molekularnymi.
Badania MPE umożliwiają identyfikację nowego biomarkera o potencjalnym zastosowaniu klinicznym, przy użyciu danych populacyjnych na dużą skalę (np. mutacja PIK3CA w raku jelita grubego w celu wybrania pacjentów do terapii aspiryną ). Podejście MPE można zastosować po przeprowadzeniu badania asocjacyjnego całego genomu (GWAS), określanego jako „podejście GWAS-MPE”. Szczegółowe fenotypowanie punktów końcowych choroby można przeprowadzić za pomocą patologii molekularnej lub zastępczej histopatologii lub analizy immunohistochemicznej chorych tkanek i komórek w ramach GWAS.
W ramach alternatywnego podejścia, potencjalne warianty ryzyka zidentyfikowane przez GWAS mogą być badane w połączeniu z analizą patologii molekularnej na chorych tkankach. To podejście GWAS-MPE może dać nie tylko dokładniejsze oszacowania efektów, nawet większe efekty, dla określonych podtypów molekularnych choroby, ale także wgląd w patogenezę poprzez powiązanie wariantów genetycznych z molekularnymi sygnaturami patologicznymi choroby. Ponieważ diagnostyka molekularna staje się rutynową praktyką kliniczną, dane patologii molekularnej mogą wspomóc badania epidemiologiczne.
Historia
MPE rozpoczęło się od analizy czynników ryzyka (np. palenie) i molekularnych zmian patologicznych (np. mutacje onkogenu KRAS G12C w raku płuc).
Badania mające na celu zbadanie związku między ekspozycją a molekularnymi patologicznymi sygnaturami choroby (w szczególności raka) stały się coraz bardziej powszechne w latach 90. i na początku XXI wieku.
Wykorzystaniu patologii molekularnej w epidemiologii brakowało wystandaryzowanych metodologii i wytycznych, a także interdyscyplinarnych ekspertów i programów szkoleniowych. Badania MPE wymagały nowych ram koncepcyjnych i metodologii ( metoda epidemiologiczna ), ponieważ MPE bada niejednorodność zmiennej wynikowej .
Termin „molekularna epidemiologia patologiczna” został użyty przez Shuji Ogino i Meira Stampfera w 2010 roku. Konkretne zasady MPE opracowane po 2010 roku. Paradygmat MPE jest szeroko stosowany na całym świecie i był przedmiotem międzynarodowych konferencji. Seria spotkań Międzynarodowej Epidemiologii Molekularnej Epidemiologii (MPE) była otwarta dla społeczności naukowej na całym świecie, jej drugie i trzecie spotkanie odbyło się w Bostonie, odpowiednio w grudniu 2014 r. i maju 2016 r.
Zobacz też
Bibliografia
Dalsza lektura
- Gao C (2016). „Epidemiologia patologiczna molekularna w cukrzycy a ryzyko raka wątrobowokomórkowego” . Światowy Dziennik Hepatologii . 8 (27): 1119-1127. doi : 10.4254/wjh.v8.i27.1119 . PMC 5037325 . PMID 27721917 .
- Rescigno T, Micolucci L, Tecce MF, Capasso A (2017). „Bioaktywne składniki odżywcze i nutrigenomika w chorobach związanych z wiekiem” . Cząsteczki (Bazylea, Szwajcaria) . 22 (1): 105. doi : 10.3390/molekuły22010105 . PMC 6155887 . PMID 28075340 .
- Patil H, Saxena SG, Barrow CJ, Kanwar JR, Kapat A, Kanwar RK (2017). „W pogoni za marzeniem o medycynie spersonalizowanej poprzez walidację biomarkerów w raku jelita grubego”. Odkrywanie leków dzisiaj . 22 (1): 111–119. doi : 10.1016/j.drudis.2016.09.022 . PMID 27693431 .