Ibercivis - Ibercivis

Ibercivis
Logocivis.jpg
Deweloper (y) Hiszpańska Krajowa Rada ds. Badań i Fundacja Ibercivis
Status rozwoju Aktywny
System operacyjny Wieloplatformowy
Platforma BOINC
Średnia wydajność 13.936 TeraFLOPS
Aktywni użytkownicy 917
Całkowita liczba użytkowników 924
Aktywni gospodarze 2375
Wszystkich gospodarzy 2383
Stronie internetowej https://boinc.ibercivis.es/

Ibercivis jest Distributed Computing platforma, która umożliwia dostęp do Internetu użytkownikom uczestniczyć w badaniach naukowych, przekazując niewykorzystanych cykli komputera , aby uruchomić symulacje naukowe i inne zadania. Pierwotny projekt, który został uruchomiony w 2008 r., Był wynikiem współpracy naukowej między rządami Portugalii i Hiszpanii , ale jest otwarty dla ogółu społeczeństwa i społeczności naukowej, zarówno na Półwyspie Iberyjskim , jak i poza nim . Nazwa projektu jest kufer z „ Iberia ” i łacińskich słów Civis , czyli „ obywatel ”.

W kwietniu 2020 roku platforma obliczeniowa rozproszona została ponownie uruchomiona przez Fundację Ibercivis i Hiszpańską Krajową Radę ds.Badań w celu zbadania istniejących leków pod kątem aktywności przeciwwirusowej przeciwko koronawirusowi 2 ciężkiego ostrego zespołu oddechowego , który jest przyczyną pandemii COVID-19 .

Historia

Ibercivis został opracowany w Hiszpanii we współpracy z Instytutem Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych Uniwersytetu w Saragossie , CIEMAT , CETA-CIEMAT, Hiszpańską Krajową Radą Badawczą (CSIC) i RedIris. Zadania projektowe są realizowane przez różne ośrodki naukowe i technologiczne w Hiszpanii w celu stworzenia funkcjonalnej platformy dla rozproszonego przetwarzania naukowego opartego na wolontariacie . Projekt jest europejskim odpowiednikiem odnoszących sukcesy amerykańskich projektów SETI @ home i Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC).

Poprzednik Ibercivis, projekt obliczeń rozproszonych Zivis na Uniwersytecie w Saragossie , rozpoczął działalność w 2007 r., A sam Ibercivis rozpoczął działalność w czerwcu 2008 r. Projekt Zivis był lokalną aplikacją obliczeniową rozproszoną finansowaną przez ayuntamiento (radę miasta). Saragossa . Infrastrukturę Ibercivis na większą skalę wykorzystywano do różnych obliczeń, w tym do badań nad syntezą jądrową , składania białek i symulacji materiałów . W lipcu 2009 r. Platforma Ibercivis została rozszerzona na Portugalię w wyniku porozumienia podpisanego przez rządy obu krajów podczas szczytu Luso-Hiszpanii, który odbył się w Zamorze w Hiszpanii w styczniu 2009 r. Kilka portugalskich instytucji zostało następnie stowarzyszonych z Ibercivis, w tym Ministerstwo Nauka The Center for Neuroscience i Biologii komórki na Uniwersytecie w Coimbrze , a LIP eksperymentalna fizyka wysokich energii laboratorium.

W kwietniu 2020 r. Uruchomiono nowy projekt Ibercivis, aby wspierać wysiłki naukowców w walce z chorobą koronawirusową 2019 .

Liczba uczestników

W momencie powstania w czerwcu 2008 r. Ibercivis miał 3000 zarejestrowanych użytkowników, którzy hostowali różne projekty. Do grudnia 2012 roku liczba ta wzrosła do ponad 19 800 w 124 krajach. W projekcie zarejestrowano około 55 000 indywidualnych urządzeń hostingowych, z czego ponad 3600 było aktywnych tygodniowo.

W kwietniu 2020 r. Było 917 aktywnych użytkowników i 2375 aktywnych gospodarzy w nowym powstaniu Ibercivis.

Projektowanie

Ibercivis ma działać przez czas nieokreślony i jest przeznaczony do uruchamiania kilku jednoczesnych aplikacji należących do różnych dyscyplin naukowych, w sposób podobny do finansowanego przez IBM World Community Grid . Użytkownicy mogą wybrać projekty, w których chcą wnieść swój wkład za pośrednictwem strony internetowej projektu. Od maja 2020 Ibercivis obejmuje osiem różnych aktywnych projektów:

Aktywne projekty

COVID-Phym : Przeprowadź badanie przesiewowe istniejących leków pod kątem aktywności przeciwwirusowej przeciwko koronawirusowi 2 zespołu ostrej niewydolności oddechowej , który jest czynnikiem wywołującym pandemię COVID-19 .

Poprzednie projekty

Projekty Ibercivis, które zostały zakończone lub przerwane od maja 2020 roku obejmują:

  • Fusion: gwiazda na ekranie : ta aplikacja pomogła naukowcom z Centrum Badań nad Środowiskiem i Technologią Energii (CIEMAT) oraz z Instytutu Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych (BIFI) przeprowadzić symulacje plazmy, które zostaną wyprodukowane w Międzynarodowym Eksperymentalny reaktor termojądrowy (ITER). Projekt ITER, który rozpocznie się w 2018 r., Ma na celu urzeczywistnienie energii syntezy jądrowej , powielając warunki panujące na Ziemi zwykle w gwiazdach .
  • Dokowanie: poszukiwanie leków przeciwnowotworowych : aplikacja Docking wspomagała poszukiwanie nowych leków poprzez symulację dokowania białek . Jednostka bioinformatyki Centro de Biología Molecular Severo Ochoa ( CSIC -UAM) opracowała platformę umożliwiającą automatyczną symulację interakcji białek i małych cząsteczek. Jego celem było znalezienie skutecznych leków do leczenia poważnych chorób, takich jak rak .
  • Materiały: Symulacja układów magnetycznych : materiały aplikacyjne wspomagane fizyków z Universidad Complutense de Madrid , Universidad de Extremadura oraz Instytut Biocomputation i Fizyki Systemów Złożonych w odkrywaniu jak zanieczyszczenia niemagnetyczne na magnetycznych materiałów modyfikowanie właściwości ich przejście od stan magnetyczny na niemagnetyczny. Znajomość tych przejść jest ważna nie tylko z teoretycznego punktu widzenia, ale może również pomóc w rozwoju wielu dziedzin technologii , takich jak magnetyczne dyski twarde i materiały nadprzewodzące .
  • Nanoluz: światło w nanoskali : wiedza o tym, jak światło reaguje w skali nanometrów, jest wyzwaniem naukowym o ważnych implikacjach dla konstrukcji nowych materiałów, rozwoju nowych systemów obliczeniowych i komunikacyjnych oraz ulepszania technologii, takich jak panele słoneczne . Korzystając z aplikacji Nanoluz, naukowcy z Instytutu Optyki Daza Valdés CSIC zbadali zachowanie światła w nanocząstkach metali , starając się opracować systemy, które mogłyby uprościć analizę medyczną i biologiczną.
  • IberNet: zbadajmy wewnątrz Ibercivis : w ramach tego projektu naukowcy starali się zbadać i przedstawić strukturę Ibercivis jako sieci społecznościowej oraz spróbować wyeksportować swoje wnioski do innych sieci społecznościowych, aby pomóc w badaniu i przewidywaniu dynamiki masowej społeczności środowisko.
  • Amiloide: poszukiwanie leków przeciwko neurodegeneracyjnym chorobom amyloidowym : projekt AMILOIDE ma na celu przeszukanie cyfrowych bibliotek milionów związków pod kątem potencjalnych leków zakłócających tworzenie agregatów i włókien amyloidowych , co może prowadzić do chorób neurodegeneracyjnych . Obecnie głównymi badanymi chorobami docelowymi są rodzinna polineuropatia amyloidowa (FAP) i choroba Alzheimera . Za ten projekt odpowiadają naukowcy z Grupy Biologii Strukturalnej i Obliczeniowej w Centrum Neuronauki i Biologii Komórkowej (CNC) Uniwersytetu w Coimbrze .
  • Neurosim: zanurzenie w molekularnej strukturze pamięci : naukowcy z Instytutu Struktury Materii CSIC wykorzystują wyniki aplikacji Neurosim do analizy właściwości strukturalnych aminokwasów i małych peptydów (sekwencje kilkudziesięciu aminokwasów), które działają w ludzkim mózgu i układzie nerwowym . Symulując tak zwany krajobraz energetyczny dla każdego aminokwasu, można poczynić kluczowe kroki w rekonstrukcji trójwymiarowej struktury białek z sekwencji aminokwasów, postępując w badaniach nad strukturą i funkcją ludzkiego mózgu.
  • Adsorpcja: zachowanie zamkniętych płynów w ograniczonych przestrzeniach : aplikacja Adsorption pomaga naukowcom z Instituto de Química-Física Rocasolano z CSIC w badaniu właściwości adsorpcyjnych glin słupkowych, które są szeroko stosowane jako katalizatory przemysłowe , materiały do ​​magazynowania gazów i przemysłowe środki rozdzielające . Ten rodzaj gliny jest wykorzystywany w procesach przemysłowych, takich jak produkcja biopaliw z olejów roślinnych , przechowywanie gazu ziemnego w temperaturze pokojowej oraz magazynowanie gazów cieplarnianych wytwarzanych przez przemysł.
  • Kable kablowe: symulacje drutów kwantowych : naukowcy z Uniwersytetu w Buenos Aires używają tej aplikacji do badania stopnia, w jakim błędy w materiale przewodów kwantowych mają wpływ na ich prąd elektryczny . W tym celu opracowują model teoretyczny, który symuluje drut kwantowy, zanieczyszczenia i elektrody, z którymi łączy się drut kwantowy, oraz badają zachowanie prądu, który jest generowany w przewodzie, gdy jest do niego przyłożone napięcie zewnętrzne.
  • Sanidad: ulepszona diagnostyka : promieniowanie jonizujące jest wykorzystywane w medycynie, począwszy od podstawowych testów diagnostycznych w nowoczesnym szpitalu (w radiologii , medycynie nuklearnej i badaniach laboratoryjnych), a skończywszy na leczeniu raka za pomocą radioterapii . Do tych celów można wykorzystać zarówno rzeczywiste materiały radioaktywne (w postaci nasion lub materiału do wstrzykiwania), jak i złożony sprzęt, który generuje wiązki fotonów i elektrony . Fizycy z Andaluzji wykorzystują symulacje Sanidad, aby poszerzyć wiedzę na temat bezpiecznego stosowania promieniowania w opiece zdrowotnej i zbadać potencjalne nowe zastosowania.
  • Criticalidad: transport elektronów w nieuporządkowanych układach o właściwościach fraktalnych : projekt Criticalidad pomaga meksykańskim badaczom zrozumieć właściwości i skutki fraktalności w transporcie elektronów przez nieuporządkowane układy w przejściu Andersona .
  • Soluvel: badanie rozpuszczalności związków toksycznych i farmaceutycznych: celem projektu Soluvel jest obliczenie energii solwatacji niektórych rozpuszczalnych związków, aby poprzez obliczenia określić, które związki mogą być toksyczne dla ludzi, a które mogą służyć jako skuteczne leki. Projekt jest prowadzony przez naukowców z Laboratorium Symulacji Molekularnej Inżynierii Separacji i Reakcji (LSRE), oddziału Wydziału Inżynierii Uniwersytetu w Porto .
  • Primalidad: szukaj liczb pierwszych Wilsona: projekt „nauki obywatelskiej” otwarty dla wszystkich matematyków, aplikacja Primalidad wyszukuje następną liczbę pierwszą Wilsona - pierwsze trzy to 5, 13 i 563. Przypuszcza się, że czwarta liczba pierwsza Wilsona musi być większa niż 5 × 10 8 .

Zobacz też

Bibliografia

  1. ^ "Ibercivis BOINC" . Ibercivis . 2020-05-16 . Źródło 16.05.2020 .
  2. ^ a b de Zutter, W. (19 kwietnia 2013). „Ibercivis: przegląd kredytów” . BoincStats.com. Zarchiwizowane od oryginału w dniu 6 stycznia 2012 r . Źródło 19 kwietnia 2013 r .
  3. ^ "Ibercivis BOINC - Stan serwera" . Ibercivis BOINC . 2020-05-16 . Źródło 16.05.2020 .
  4. ^ „Często zadawane pytania” . Ibercivis.es . Źródło 2011-02-20 .
  5. ^ Ibercivis.pt - Projekty . Źródło 2011-10-15.
  6. ^ „PROYECTO COVID-PHYM” . Ibercivis . Źródło 16.05.2020 .
  7. ^ Ibercivis.pt - Poprzednie projekty. Źródło 2011-10-15.
  8. ^ AMILOIDE, The Movie - Inception Style Trailer , youtube.com
  9. ^ Ibercivis.pt - Criticalidad. Źródło 2011-10-15.
  10. ^ Ibercivis.pt - Soluvel. Źródło 2011-10-15.
  11. ^ Ibercivis.pt - Primalidad . Źródło 2011-10-15.

Linki zewnętrzne