Ibercivis - Ibercivis
Deweloper (y) | Hiszpańska Krajowa Rada ds. Badań i Fundacja Ibercivis |
---|---|
Status rozwoju | Aktywny |
System operacyjny | Wieloplatformowy |
Platforma | BOINC |
Średnia wydajność | 13.936 TeraFLOPS |
Aktywni użytkownicy | 917 |
Całkowita liczba użytkowników | 924 |
Aktywni gospodarze | 2375 |
Wszystkich gospodarzy | 2383 |
Stronie internetowej | https://boinc.ibercivis.es/ |
Ibercivis jest Distributed Computing platforma, która umożliwia dostęp do Internetu użytkownikom uczestniczyć w badaniach naukowych, przekazując niewykorzystanych cykli komputera , aby uruchomić symulacje naukowe i inne zadania. Pierwotny projekt, który został uruchomiony w 2008 r., Był wynikiem współpracy naukowej między rządami Portugalii i Hiszpanii , ale jest otwarty dla ogółu społeczeństwa i społeczności naukowej, zarówno na Półwyspie Iberyjskim , jak i poza nim . Nazwa projektu jest kufer z „ Iberia ” i łacińskich słów Civis , czyli „ obywatel ”.
W kwietniu 2020 roku platforma obliczeniowa rozproszona została ponownie uruchomiona przez Fundację Ibercivis i Hiszpańską Krajową Radę ds.Badań w celu zbadania istniejących leków pod kątem aktywności przeciwwirusowej przeciwko koronawirusowi 2 ciężkiego ostrego zespołu oddechowego , który jest przyczyną pandemii COVID-19 .
Historia
Ibercivis został opracowany w Hiszpanii we współpracy z Instytutem Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych Uniwersytetu w Saragossie , CIEMAT , CETA-CIEMAT, Hiszpańską Krajową Radą Badawczą (CSIC) i RedIris. Zadania projektowe są realizowane przez różne ośrodki naukowe i technologiczne w Hiszpanii w celu stworzenia funkcjonalnej platformy dla rozproszonego przetwarzania naukowego opartego na wolontariacie . Projekt jest europejskim odpowiednikiem odnoszących sukcesy amerykańskich projektów SETI @ home i Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC).
Poprzednik Ibercivis, projekt obliczeń rozproszonych Zivis na Uniwersytecie w Saragossie , rozpoczął działalność w 2007 r., A sam Ibercivis rozpoczął działalność w czerwcu 2008 r. Projekt Zivis był lokalną aplikacją obliczeniową rozproszoną finansowaną przez ayuntamiento (radę miasta). Saragossa . Infrastrukturę Ibercivis na większą skalę wykorzystywano do różnych obliczeń, w tym do badań nad syntezą jądrową , składania białek i symulacji materiałów . W lipcu 2009 r. Platforma Ibercivis została rozszerzona na Portugalię w wyniku porozumienia podpisanego przez rządy obu krajów podczas szczytu Luso-Hiszpanii, który odbył się w Zamorze w Hiszpanii w styczniu 2009 r. Kilka portugalskich instytucji zostało następnie stowarzyszonych z Ibercivis, w tym Ministerstwo Nauka The Center for Neuroscience i Biologii komórki na Uniwersytecie w Coimbrze , a LIP eksperymentalna fizyka wysokich energii laboratorium.
W kwietniu 2020 r. Uruchomiono nowy projekt Ibercivis, aby wspierać wysiłki naukowców w walce z chorobą koronawirusową 2019 .
Liczba uczestników
W momencie powstania w czerwcu 2008 r. Ibercivis miał 3000 zarejestrowanych użytkowników, którzy hostowali różne projekty. Do grudnia 2012 roku liczba ta wzrosła do ponad 19 800 w 124 krajach. W projekcie zarejestrowano około 55 000 indywidualnych urządzeń hostingowych, z czego ponad 3600 było aktywnych tygodniowo.
W kwietniu 2020 r. Było 917 aktywnych użytkowników i 2375 aktywnych gospodarzy w nowym powstaniu Ibercivis.
Projektowanie
Ibercivis ma działać przez czas nieokreślony i jest przeznaczony do uruchamiania kilku jednoczesnych aplikacji należących do różnych dyscyplin naukowych, w sposób podobny do finansowanego przez IBM World Community Grid . Użytkownicy mogą wybrać projekty, w których chcą wnieść swój wkład za pośrednictwem strony internetowej projektu. Od maja 2020 Ibercivis obejmuje osiem różnych aktywnych projektów:
Aktywne projekty
COVID-Phym : Przeprowadź badanie przesiewowe istniejących leków pod kątem aktywności przeciwwirusowej przeciwko koronawirusowi 2 zespołu ostrej niewydolności oddechowej , który jest czynnikiem wywołującym pandemię COVID-19 .
Poprzednie projekty
Projekty Ibercivis, które zostały zakończone lub przerwane od maja 2020 roku obejmują:
- Fusion: gwiazda na ekranie : ta aplikacja pomogła naukowcom z Centrum Badań nad Środowiskiem i Technologią Energii (CIEMAT) oraz z Instytutu Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych (BIFI) przeprowadzić symulacje plazmy, które zostaną wyprodukowane w Międzynarodowym Eksperymentalny reaktor termojądrowy (ITER). Projekt ITER, który rozpocznie się w 2018 r., Ma na celu urzeczywistnienie energii syntezy jądrowej , powielając warunki panujące na Ziemi zwykle w gwiazdach .
- Dokowanie: poszukiwanie leków przeciwnowotworowych : aplikacja Docking wspomagała poszukiwanie nowych leków poprzez symulację dokowania białek . Jednostka bioinformatyki Centro de Biología Molecular Severo Ochoa ( CSIC -UAM) opracowała platformę umożliwiającą automatyczną symulację interakcji białek i małych cząsteczek. Jego celem było znalezienie skutecznych leków do leczenia poważnych chorób, takich jak rak .
- Materiały: Symulacja układów magnetycznych : materiały aplikacyjne wspomagane fizyków z Universidad Complutense de Madrid , Universidad de Extremadura oraz Instytut Biocomputation i Fizyki Systemów Złożonych w odkrywaniu jak zanieczyszczenia niemagnetyczne na magnetycznych materiałów modyfikowanie właściwości ich przejście od stan magnetyczny na niemagnetyczny. Znajomość tych przejść jest ważna nie tylko z teoretycznego punktu widzenia, ale może również pomóc w rozwoju wielu dziedzin technologii , takich jak magnetyczne dyski twarde i materiały nadprzewodzące .
- Nanoluz: światło w nanoskali : wiedza o tym, jak światło reaguje w skali nanometrów, jest wyzwaniem naukowym o ważnych implikacjach dla konstrukcji nowych materiałów, rozwoju nowych systemów obliczeniowych i komunikacyjnych oraz ulepszania technologii, takich jak panele słoneczne . Korzystając z aplikacji Nanoluz, naukowcy z Instytutu Optyki Daza Valdés CSIC zbadali zachowanie światła w nanocząstkach metali , starając się opracować systemy, które mogłyby uprościć analizę medyczną i biologiczną.
- IberNet: zbadajmy wewnątrz Ibercivis : w ramach tego projektu naukowcy starali się zbadać i przedstawić strukturę Ibercivis jako sieci społecznościowej oraz spróbować wyeksportować swoje wnioski do innych sieci społecznościowych, aby pomóc w badaniu i przewidywaniu dynamiki masowej społeczności środowisko.
- Amiloide: poszukiwanie leków przeciwko neurodegeneracyjnym chorobom amyloidowym : projekt AMILOIDE ma na celu przeszukanie cyfrowych bibliotek milionów związków pod kątem potencjalnych leków zakłócających tworzenie agregatów i włókien amyloidowych , co może prowadzić do chorób neurodegeneracyjnych . Obecnie głównymi badanymi chorobami docelowymi są rodzinna polineuropatia amyloidowa (FAP) i choroba Alzheimera . Za ten projekt odpowiadają naukowcy z Grupy Biologii Strukturalnej i Obliczeniowej w Centrum Neuronauki i Biologii Komórkowej (CNC) Uniwersytetu w Coimbrze .
- Neurosim: zanurzenie w molekularnej strukturze pamięci : naukowcy z Instytutu Struktury Materii CSIC wykorzystują wyniki aplikacji Neurosim do analizy właściwości strukturalnych aminokwasów i małych peptydów (sekwencje kilkudziesięciu aminokwasów), które działają w ludzkim mózgu i układzie nerwowym . Symulując tak zwany krajobraz energetyczny dla każdego aminokwasu, można poczynić kluczowe kroki w rekonstrukcji trójwymiarowej struktury białek z sekwencji aminokwasów, postępując w badaniach nad strukturą i funkcją ludzkiego mózgu.
- Adsorpcja: zachowanie zamkniętych płynów w ograniczonych przestrzeniach : aplikacja Adsorption pomaga naukowcom z Instituto de Química-Física Rocasolano z CSIC w badaniu właściwości adsorpcyjnych glin słupkowych, które są szeroko stosowane jako katalizatory przemysłowe , materiały do magazynowania gazów i przemysłowe środki rozdzielające . Ten rodzaj gliny jest wykorzystywany w procesach przemysłowych, takich jak produkcja biopaliw z olejów roślinnych , przechowywanie gazu ziemnego w temperaturze pokojowej oraz magazynowanie gazów cieplarnianych wytwarzanych przez przemysł.
- Kable kablowe: symulacje drutów kwantowych : naukowcy z Uniwersytetu w Buenos Aires używają tej aplikacji do badania stopnia, w jakim błędy w materiale przewodów kwantowych mają wpływ na ich prąd elektryczny . W tym celu opracowują model teoretyczny, który symuluje drut kwantowy, zanieczyszczenia i elektrody, z którymi łączy się drut kwantowy, oraz badają zachowanie prądu, który jest generowany w przewodzie, gdy jest do niego przyłożone napięcie zewnętrzne.
- Sanidad: ulepszona diagnostyka : promieniowanie jonizujące jest wykorzystywane w medycynie, począwszy od podstawowych testów diagnostycznych w nowoczesnym szpitalu (w radiologii , medycynie nuklearnej i badaniach laboratoryjnych), a skończywszy na leczeniu raka za pomocą radioterapii . Do tych celów można wykorzystać zarówno rzeczywiste materiały radioaktywne (w postaci nasion lub materiału do wstrzykiwania), jak i złożony sprzęt, który generuje wiązki fotonów i elektrony . Fizycy z Andaluzji wykorzystują symulacje Sanidad, aby poszerzyć wiedzę na temat bezpiecznego stosowania promieniowania w opiece zdrowotnej i zbadać potencjalne nowe zastosowania.
- Criticalidad: transport elektronów w nieuporządkowanych układach o właściwościach fraktalnych : projekt Criticalidad pomaga meksykańskim badaczom zrozumieć właściwości i skutki fraktalności w transporcie elektronów przez nieuporządkowane układy w przejściu Andersona .
- Soluvel: badanie rozpuszczalności związków toksycznych i farmaceutycznych: celem projektu Soluvel jest obliczenie energii solwatacji niektórych rozpuszczalnych związków, aby poprzez obliczenia określić, które związki mogą być toksyczne dla ludzi, a które mogą służyć jako skuteczne leki. Projekt jest prowadzony przez naukowców z Laboratorium Symulacji Molekularnej Inżynierii Separacji i Reakcji (LSRE), oddziału Wydziału Inżynierii Uniwersytetu w Porto .
- Primalidad: szukaj liczb pierwszych Wilsona: projekt „nauki obywatelskiej” otwarty dla wszystkich matematyków, aplikacja Primalidad wyszukuje następną liczbę pierwszą Wilsona - pierwsze trzy to 5, 13 i 563. Przypuszcza się, że czwarta liczba pierwsza Wilsona musi być większa niż 5 × 10 8 .
Zobacz też
- Crowdsourcing
- Lista projektów obliczeń rozproszonych
- Nauka i technologia w Portugalii
- Superkomputery w Europie
Bibliografia
- ^ "Ibercivis BOINC" . Ibercivis . 2020-05-16 . Źródło 16.05.2020 .
- ^ a b de Zutter, W. (19 kwietnia 2013). „Ibercivis: przegląd kredytów” . BoincStats.com. Zarchiwizowane od oryginału w dniu 6 stycznia 2012 r . Źródło 19 kwietnia 2013 r .
- ^ "Ibercivis BOINC - Stan serwera" . Ibercivis BOINC . 2020-05-16 . Źródło 16.05.2020 .
- ^ „Często zadawane pytania” . Ibercivis.es . Źródło 2011-02-20 .
- ^ Ibercivis.pt - Projekty . Źródło 2011-10-15.
- ^ „PROYECTO COVID-PHYM” . Ibercivis . Źródło 16.05.2020 .
- ^ Ibercivis.pt - Poprzednie projekty. Źródło 2011-10-15.
- ^ AMILOIDE, The Movie - Inception Style Trailer , youtube.com
- ^ Ibercivis.pt - Criticalidad. Źródło 2011-10-15.
- ^ Ibercivis.pt - Soluvel. Źródło 2011-10-15.
- ^ Ibercivis.pt - Primalidad . Źródło 2011-10-15.
Linki zewnętrzne
- Oficjalna strona internetowa
- Oficjalna portugalska strona internetowa
- Oficjalna hiszpańska strona internetowa
- Ibercivis - hiszpańska strona BOINC
- Ibercivis - portugalska strona BOINC
- BIFI - Instytut Biokomputerów i Fizyki Systemów Złożonych
- Centrum Neuronauki i Biologii Komórki
- Uniwersytet w Saragossie
- CIEMAT - Centro de Investigationes Energeticas, Medioambientales y Tecnologicas
- ITER - Międzynarodowy eksperymentalny reaktor termojądrowy