Histon H3 - Histone H3
Histon H3, rodzina 3A (H3.3A) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||
Symbol | H3F3A | ||||||
Alt. symbolika | H3F3 | ||||||
gen NCBI | 3020 | ||||||
HGNC | 4764 | ||||||
OMIM | 601128 | ||||||
RefSeq | NM_002107 | ||||||
UniProt | Q66I33 | ||||||
Inne dane | |||||||
Umiejscowienie | Chr. 1 kwartał 41 | ||||||
|
Histon H3, rodzina 3B (H3.3B) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||
Symbol | H3F3B | ||||||
gen NCBI | 3021 | ||||||
HGNC | 4765 | ||||||
OMIM | 601058 | ||||||
RefSeq | NM_005324 | ||||||
UniProt | P84243 | ||||||
Inne dane | |||||||
Umiejscowienie | Chr. 17 kwartał 25 | ||||||
|
Histon H3 jest jednym z pięciu głównych histonów biorących udział w budowie chromatyny w komórkach eukariotycznych . Posiadając główną domenę kulistą i długi ogon N-końcowy , H3 bierze udział w budowie nukleosomów struktury „perełek na strunie”. Białka histonowe są silnie zmodyfikowane potranslacyjnie, jednak Histon H3 jest najbardziej zmodyfikowany z pięciu histonów. Sam termin „histon H3” jest celowo niejednoznaczny, ponieważ nie rozróżnia wariantów sekwencji lub stanu modyfikacji. Histon H3 jest ważnym białkiem w rozwijającej się dziedzinie epigenetyki, gdzie uważa się, że warianty sekwencji i zmienne stany modyfikacji odgrywają rolę w dynamicznej i długoterminowej regulacji genów.
Epigenetyka i modyfikacje potranslacyjne
N-koniec H3 wystaje z kulistego rdzenia nukleosomu i jest podatny na modyfikacje potranslacyjne, które wpływają na procesy komórkowe. Modyfikacje te obejmują kowalencyjne przyłączenie grup metylowych lub acetylowych do aminokwasów lizyny i argininy oraz fosforylację seryny lub treoniny . Di- i tri-metylacja lizyny 9 jest związana z represją i heterochromatyną (patrz H3K9me2 i H3K9me3 ), podczas gdy monometylacja K4 (K4 odpowiada reszcie lizyny w pozycji 4) (patrz H3K4me1 ) jest związana z aktywnymi genami. Acetylowanie histonu H3 w kilku pozycjach lizyny w ogonie histonu jest przeprowadzane przez enzymy acetylotransferazy histonowej (HAT). Acetylowanie lizyny14 jest powszechnie obserwowane w genach, które są aktywnie transkrybowane do RNA (patrz H3K14ac ).
Warianty sekwencji
Komórki ssaków mają siedem znanych wariantów sekwencji histonu H3. Są one oznaczone jako Histone H3.1, Histone H3.2, Histone H3.3, Histone H3.4 (H3T), Histone H3.5, Histone H3.X i Histone H3.Y, ale mają wysoce konserwatywne sekwencje różniące się tylko kilka aminokwasów. Stwierdzono, że histon H3.3 odgrywa ważną rolę w utrzymaniu integralności genomu podczas rozwoju ssaków. Warianty histonów z różnych organizmów, ich klasyfikację i cechy charakterystyczne dla wariantów można znaleźć w bazie danych „HistoneDB - with Variants” .
Genetyka
Histony H3 są kodowane przez kilka genów w ludzkim genomie, w tym:
- H3.1: HIST1H3A , HIST1H3B , HIST1H3C , HIST1H3D , HIST1H3E , HIST1H3F , HIST1H3G , HIST1H3H , HIST1H3I , HIST1H3J
- H3.2: HIST2H3A , HIST2H3C , HIST2H3D
- H3.3: H3F3A , H3F3B