Haplogrupa J (Y-DNA) - Haplogroup J (Y-DNA)

Haplogrupa J-M304
Haplogrupa J (Y-DNA).PNG
Możliwy czas powstania 42 900 lat temu
Wiek koalescencyjny 31 600 lat temu
Możliwe miejsce pochodzenia Zachodnia Azja
Przodek IJ
Potomków J-M172 , J-M267
Definiowanie mutacji M304/strona16/PF4609, 12f2.1
Najwyższe częstotliwości inguski , czeczeński

Haplogrupa J- M304 , znana również jako J , jest haplogrupą DNA ludzkiego chromosomu Y . Uważa się, że ewoluował w zachodniej Azji . Rozprzestrzenianie klad stamtąd podczas neolitu , głównie w Afryce Północnej , w Rogu Afryki , Sokotra , na Kaukazie , Europie , Azji Zachodniej , Azji Środkowej , Azji Południowej i Azji Południowo-Wschodniej .

Haplogroup J-M304 dzieli się na dwie główne subklady (gałęzie), J-M267 i J-M172 .

Początki

Haplogrupy J-M304 Uważa się, że rozłam z haplogrupy I-M170 w przybliżeniu 43.000 lat temu w Azji Zachodniej, ponieważ oba rodowody są haplogrupy IJ subclades . Haplogrupa IJ i haplogrupa K wywodzą się z haplogrupy IJK i dopiero na tym poziomie klasyfikacji haplogrupa IJK łączy się z Haplogrupą G-M201 i Haplogrupą H jako bezpośredni potomkowie Haplogrupy F-M89 . J-M304 jest zdefiniowany przez marker genetyczny M304 lub równoważny marker 12f2.1. Uważa się, że główne obecne podgrupy J-M267 i J-M172, które obecnie obejmują między sobą prawie wszystkie linie potomne haplogrupy, powstały bardzo wcześnie, co najmniej 10 000 lat temu. Niemniej jednak na irańskim płaskowyżu zaobserwowano chromosomy Y F-M89* i IJ-M429* (Grugni et al. 2012).

Z drugiej strony wydaje się, że różne epizody ruchu ludności wpłynęły na południowo-wschodnią Europę, a rola Bałkanów jako długiego korytarza do Europy z Bliskiego Wschodu pokazuje filogenetyczne zjednoczenie Hgs I i J przez podstawową mutację M429. Ten dowód wspólnego pochodzenia sugeruje, że przodek Hgs IJ-M429* prawdopodobnie wkroczył do Europy szlakiem bałkańskim jakiś czas przed LGM . Następnie podzielili się na Hg J i Hg I na Bliskim Wschodzie iw Europie w typowym dysjunktywnym wzorze filogeograficznym. Taka hala geograficzna prawdopodobnie napotkała dodatkowe strumienie genów, w tym osadników ogrodniczych. Co więcej, ujednolicenie haplogrup IJK tworzy dystans ewolucyjny od delegatów F–H, a także potwierdza wniosek, że zarówno IJ-M429, jak i KT-M9 powstały bliżej Bliskiego Wschodu niż Azji Środkowej czy Wschodniej.

Haplogrupa J została również znaleziona wśród dwóch starożytnych egipskich mumii wykopanych na stanowisku archeologicznym Abusir el-Meleq w środkowym Egipcie, które pochodzą z okresu między późnym Nowym Państwem a erą rzymską .

Dystrybucja

Haplogrupa J-M304 występuje w największej koncentracji na Półwyspie Arabskim . Poza tym regionem haplogrupa J-M304 ma znaczącą obecność w innych częściach Bliskiego Wschodu, a także w Afryce Północnej , Rogu Afryki i Kaukazie . Występuje również umiarkowanie w Europie Południowej , zwłaszcza w środkowych i południowych Włoszech, Malcie, Grecji i Albanii. Subklad J-M410 jest głównie dystrybuowany w Anatolii , Grecji i południowych Włoszech. Dodatkowo J-M304 jest obserwowany w Azji Środkowej i Południowej , szczególnie w postaci jego podkladu J-M172. J-12f2 i J-P19 znajdują się również wśród Herero (8%).

Kraj/region Próbowanie n J-M267 J-M172 Razem J Badanie
Algieria Oran 102 22,5 4,9 27,4 Robino 2008
Albania Tirana 30 20,0 Bosch 2006
Albania 55 23,64 Battaglia 2008
Bośnia Serbowie 81 9,9 Battaglia 2008
Kaukaz czeczeński 330 20,9 56,7 77,6 Balanowski 2011
Kaukaz Ingusze 143 2,8 88,8 91,6 Balanowski 2011
Chiny Ujgur 50 0 34,0 34,0 Shou 2010
Chiny uzbecki 23 0 30,4 34,7 Shou 2010
Chiny tadżycki 31 0 16,1 16,1 Shou 2010
Cypr 164 9,6 12,9 22,5 El-Sibai 2009
Egipt 124 19,8 7,6 27,4 El-Sibai 2009
Grecja Kreta/Heraklion 104 1,9 44,2 46,1 Martinez 2007
Grecja Kreta 143 3,5 35 38,5 El-Sibai 2009
Grecja 154 1,9 18,1 20 El-Sibai 2009
Indie Sunniccy i północnoindyjscy szyici 112 32 43,2 75,2 El-Sibai 2009
Iran 92 3.2 25 28,2 El-Sibai 2009
Irak Arab , Aramejczycy , asyryjski , Mandean 117 33,1 25,1 58,2 El-Sibai 2009
Izrael Akko (Arabowie) 101 39,2 18,6 57,8 El-Sibai 2009
Włochy 699 2 20 22 Capelli 2007
Włochy Centralny Marche 59 5.1 35,6 40,7 Capelli 2007
Włochy Zachodnia Kalabria 57 3,5 35,1 38,6 Capelli 2007
Włochy Sycylia 212 5.2 22,6 27,8 El-Sibai 2009
Włochy Sardynia 81 4,9 9,9 14,8 El-Sibai 2009
Jordania 273 35,5 14,6 50,1 El-Sibai 2009
Kosowo Albańczycy 114 16.67 Pericic 2005
Kuwejt 42 33,3 9,5 42,8 El-Sibai 2009
Liban 951 17 29,4 46,4 El-Sibai 2009
Malta 90 7,8 21,1 28,9 El-Sibai 2009
Maroko 316 1 0,2 1.2 El-Sibai 2009
Maroko Mieszkańcy we Włoszech 51 19,6 0 19,6 Onofri 2008
Portugalia Portugalia 303 4.3 6,9 11.2 El-Sibai 2009
Katar Katar 72 58,3 8,3 66,6 El-Sibai 2009
Serbia Belgrad 113 8 Pericic 2005
Serbia 179 5,6 Mirabal 2010
Hiszpania Kadyks 28 3,6 14,3 17,9 El-Sibai 2009
Hiszpania Kantabria 70 2,9 2,9 5,8 El-Sibai 2009
Hiszpania Kastylia 21 0 9,5 9,5 El-Sibai 2009
Hiszpania Kordoba 27 0 14,7 14,7 El-Sibai 2009
Hiszpania Galicja 19 5,3 0 5,3 El-Sibai 2009
Hiszpania Huelva 22 0 13,7 13,7 El-Sibai 2009
Hiszpania Ibiza 54 0 3,7 3,7 El-Sibai 2009
Hiszpania Leon 60 1,7 5 6,7 El-Sibai 2009
Hiszpania malaga 26 0 15,4 15,4 El-Sibai 2009
Hiszpania Majorka 62 1,6 8 9,7 El-Sibai 2009
Hiszpania Sewilla 155 3.2 7,8 11 El-Sibai 2009
Hiszpania Walencja 31 2,7 5,5 8,2 El-Sibai 2009
Syria arabskie , aramejskie , asyryjskie 554 33,6 20,8 54,4 El-Sibai 2009
Tunezja 62 0 8 8 El-Sibai 2009
Tunezja 52 34,6 3,8 38,4 Onofri 2008
Tunezja Susa 220 25,9 8,2 34,1 Fadhlaoui-Zid 2015
Tunezja Tunis 148 32,4 3.4 35,8 Arredi 2004
indyk 523 9,1 24,2 33,3 El-Sibai 2009
ZEA 164 34,7 10.3 45 El-Sibai 2009
Jemen 62 72,5 9,6 82,1 El-Sibai 2009

Dystrybucja podkladu

J-M304*

Paragroup J-M304* obejmuje wszystkie J-M304 z wyjątkiem J-M267, J-M172 i ich podkladów. J-M304* jest rzadko spotykany poza wyspą Socotra, należącą do Jemenu, gdzie występuje niezwykle często na poziomie 71,4%. Haplogrupę J-M304* stwierdzono również z mniejszą częstotliwością w Omanie ( Giacomo 2004 ) , Żydów aszkenazyjskich , Arabii Saudyjskiej ( Abu- Amero 2009 ) , Grecji ( Giacomo 2004 ) , Czechach ( Giacomo 2004 i Luca 2007 ) , Uygurs i kilka ludów tureckich . ( Cinnioglu 2004 i Varzari 2006 ).

YFull i FTDNA nie znalazły jednak osób J* na całym świecie, chociaż są 2 osoby J2-Y130506 i 1 osoba J1 z Soqotra.

Poniżej znajduje się podsumowanie większości badań, które specjalnie przetestowano dla J-M267 i J-M172, pokazując jego dystrybucję w Europie, Afryce Północnej, na Bliskim Wschodzie i w Azji Środkowej.

J-M267

Haplogrupa J-M267 zdefiniowana przez SNP M267 występuje w czasach nowożytnych na Półwyspie Arabskim: Jemenie (do 76%), Arabii (do 64%) ( Alshamali 2009 ) , Katarze (58%) i Dagestanie ( do 64%). do 56%). J-M267 jest na ogół częsty wśród arabskich Beduinów (62%), Żydów aszkenazyjskich (20%) ( Semino 2004 ) , Algierii (do 35%) ( Semino 2004 ) , Iraku (28%) ( Semino 2004 ) , Tunezji (do góry do 31%), Syrii (do 30%), Egiptu (do 20%) ( Luis 2004 ) oraz Półwyspu Synaj . Do pewnego stopnia, częstość haplogrupy J-M267 zapada na granicach arabski / semickim językiem terytoriów głównie non-Arabic / semickich terytoriów mówiąc, takich jak Turcja (9%), Iranu (5%), sunnickich indyjskich muzułmanów ( 2,3%) i szyitów z północnych Indii (11%) ( Eaaswarkhanth 2009 ). Niektóre powyższe liczby są zwykle większymi wartościami uzyskanymi w niektórych badaniach, podczas gdy mniejsze liczby uzyskane w innych badaniach zostały pominięte. Jest również bardzo częsty wśród Żydów , zwłaszcza linia Kohanim (46%) ( Hammer 2009 ) .

ISOGG twierdzi, że J-M267 pochodzi z Bliskiego Wschodu . Okaże się w częściach Bliskiego Wschodu , Anatolii i północnej Afryce , ze znacznie rzadszy dystrybucji w południowej części Morza Śródziemnego bok Europie oraz w Etiopii .

Ale nie wszystkie badania zgadzają się co do miejsca ich powstania. Levant został zaproponowany ale badanie 2010 stwierdził, że haplogrupy miał bardziej północne pochodzenie, ewentualnie Anatolia .

Pochodzenie podkladu J-P58 jest prawdopodobnie w populacjach bardziej północnych, a następnie rozprzestrzenia się na południe na Półwysep Arabski . Wysoka wariancja Y-STR J-P58 w grupach etnicznych w Turcji , jak również w północnych regionach Syrii i Iraku potwierdza wnioskowanie o pochodzeniu J-P58 w pobliskiej wschodniej Anatolii . Co więcej, analiza sieciowa haplotypów J-P58 pokazuje, że niektóre populacje o niskim zróżnicowaniu, takie jak Beduini z Izraela , Kataru , Sudanu i Zjednoczonych Emiratów Arabskich , są ściśle skupione w pobliżu haplotypów o wysokiej częstotliwości. Sugeruje to, że efekt założyciela wraz z ekspansją rozbłysku gwiazd na pustyni arabskiej ( Chiaroni 2010 ) .

J-M172

Haplogrupa J-M172 występuje w najwyższych stężeniach na Kaukazie i Żyznym Półksiężycu / Iraku i występuje w całym basenie Morza Śródziemnego (w tym na Półwyspie Włoskim , Bałkańskim , Anatolijskim i Iberyjskim oraz w Afryce Północnej ) ( Giacomo 2003 ) .

Najwyższe kiedykolwiek odnotowane stężenie J-M172 wyniosło 72% w północno-wschodniej Gruzji ( Nadze 2004 ) . Inne wysokie doniesienia to Ingusze 32% ( Nasdze 2004 ) , Cypryjczycy 30-37% (Capelli 2005), Libańczycy 30% (Wells et al. 2001), Asyryjczycy , Mandejowie i Arabowie Irakijczycy 29,7% (Sanchez et al. 2005), Syryjczycy i Syryjczycy 22,5%, Kurdowie 24%-28%, Pasztunowie 20-30%, Irańczycy 23% ( Aburto 2006 ), Żydzi aszkenazyjscy 24%, Arabowie palestyńscy 16,8%-25%, Żydzi sefardyjscy 29% i szyici północnoindyjscy 18% , Czeczeni 26%, Bałkary 24%, Jaghnobis 32%, Ormianie 21-24% i Azerbejdżanie 24%-48%.

W Azji Południowej stwierdzono, że J2-M172 jest znacznie wyższy wśród kast drawidyjskich ( 19%) niż wśród kast indoeuropejskich ( 11%). J2-M172 i J-M410 znajdują się w 21% wśród średnich kast Dravidian , następnie w wyższych kastach 18,6% i niższych w 14%. ( Sengupta 2006 ) Podklady M172, takie jak M67 i M92, nie zostały znalezione ani w próbkach indyjskich, ani pakistańskich, co również może wskazywać na częściowe wspólne pochodzenie. ( Sengupta 2006 )

Według badań genetycznych w Chinach przeprowadzonych przez Shou i wsp., J2-M172 występuje z dużą częstością wśród Ujgurów (17/50 = 34%) i Uzbeków (7/23 = 30,4%), umiarkowaną wśród Pamirów ( 5/31). = 16,1%), a niska częstotliwość wśród Yugurów (2/32 = 6,3%) i Monguorów (1/50 = 2,0%). Autorzy stwierdzili również, że J-M304(xJ2-M172) z niską częstotliwością wśród Rosjan (1/19 = 5,3%), Uzbeków (1/23 = 4,3%), Sibe (1/32 = 3,1%), Dongxiangs ( 1/35 = 2,9% i Kazachowie (1/41 = 2,4%) w północno-zachodnich Chinach .

Filogenetyka

W filogenetyce chromosomu Y subklady są gałęziami haplogrup. Te subklady są również definiowane przez polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) lub unikalne polimorfizmy zdarzeń (UEP).

Historia filogenetyczna

Przed 2002 rokiem w literaturze naukowej istniało co najmniej siedem systemów nazewnictwa dla drzewa filogenetycznego chromosomu Y. Doprowadziło to do znacznego zamieszania. W 2002 roku główne grupy badawcze połączyły się i utworzyły Konsorcjum Y-Chromosome (YCC). Opublikowali wspólny artykuł, który stworzył jedno nowe drzewo, z którego wszyscy zgodzili się korzystać. Później grupa naukowców obywatelskich zainteresowanych genetyką populacyjną i genealogią genetyczną utworzyła grupę roboczą, aby stworzyć amatorskie drzewo, którego celem jest przede wszystkim bycie na czasie. Poniższa tabela zestawia wszystkie te prace w punkcie przełomowego Drzewa YCC 2002. Pozwala to badaczowi analizującemu starszą opublikowaną literaturę na szybkie przemieszczanie się między nomenklaturami.

YCC 2002/2008 (skrót) (a) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 (długoręczne) YCC 2005 (długoręczne) YCC 2008 (długoręczne) YCC 2010r (długoręczne) ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
J-12f2a 9 VI Med 23 Eu10 H4 b J* J J J - - - - - - J
J-M62 9 VI Med 23 Eu10 H4 b J1 J1a J1a J1a - - - - - - Prywatny
J-M172 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2* J2 J2 J2 - - - - - - J2
J-M47 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2a J2a J2a1 J2a4a - - - - - - J2a1a
J-M68 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2b J2b J2a3 J2a4c - - - - - - J2a1c
J-M137 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2c J2c J2a4 J2a4h2a1 - - - - - - J2a1h2a1a
J-M158 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2d J2d J2a5 J2a4h1 - - - - - - J2a1h1
J-M12 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2e* J2e J2b J2b - - - - - - J2b
J-M102 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2e1* J2e1 J2b J2b - - - - - - J2b
J-M99 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2e1a J2e1a J2b2a J2b2a - - - - - - Prywatny
J-M67 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2f* J2f J2a2 J2a4b - - - - - - J2a1b
J-M92 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2f1 J2f1 J2a2a J2a4b1 - - - - - - J2a1b1
J-M163 9 VI Med 24 Eu9 H4 b J2f2 J2f2 J2a2b J2a4b2 - - - - - - Prywatny

Publikacje naukowe

W tworzeniu drzewa YCC reprezentowane były następujące zespoły badawcze według swoich publikacji.

Drzewa filogenetyczne

Istnieje kilka potwierdzonych i proponowanych drzew filogenetycznych dostępnych dla haplogrupy J-M304. Naukowo akceptowaną jest konsorcjum Y-Chromosome Consortium (YCC), opublikowane w Karafet 2008, a następnie zaktualizowane. Projekt drzewa, który pokazuje wschodzącą naukę, został dostarczony przez Thomasa Krahna z Genomic Research Center w Houston w Teksasie . Międzynarodowe Towarzystwo Genealogii Genetycznej (ISOGG) zapewnia również drzewo amatorskie.

Drzewo szkicu Centrum Badań Genomicznych

To jest Thomas Krahn z Genomic Research Center's Draft Tree Proposed Tree dla haplogrupy J-P209 ( Krahn & FTDNA 2013 ) . Dla zwięzłości pokazane są tylko pierwsze trzy poziomy podkladów.

  • J-M304 12f2a, 12f2.1, M304, P209, L60, L134
    • M267, L255, L321, L765, L814, L827, L1030
      • M62
      • M365,1
      • L136, L572, L620
        • M390
        • P56
        • P58, L815, L828
        • L256
      • Z1828, Z1829, Z1832, Z1833, Z1834, Z1836, Z1839, Z1840, Z1841, Z1843, Z1844
        • Z1842
        • L972
    • M172, L228
      • M410, L152, L212, L505, L532, L559
        • M289
        • L26, L27, L927
        • L581
      • M12, M102, M221, M314, L282
        • M205
        • M241

Drzewo konsorcjum chromosomów Y

Jest to oficjalne drzewo naukowe produkowane przez konsorcjum Y-Chromosome Consortium (YCC). Ostatnia duża aktualizacja miała miejsce w 2008 roku ( Karafet 2008 ) . Kolejne aktualizacje były kwartalne i półroczne. Obecna wersja jest rewizją aktualizacji z 2010 roku.

Zobacz też

Genetyka

Podklady Y-DNA J

Bibliografia

Prace cytowane

Czasopisma

Tezy i rozprawy

Blogi

Listy mailingowe

Dalsza lektura

Uwagi filogenetyczne

Zewnętrzne linki

Drzewo filogenetyczne i mapy dystrybucji haplogrupy Y-DNA J

Inne

Drzewo filogenetyczne haplogrup DNA ludzkiego chromosomu Y
Adam z chromosomem Y
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
b CT
DE CF
D mi C F
F1  F2  F3  GHIJK
g HIJK
IJK h
IJ K
i   J     LT        K2 
L     T    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  P 
NIE   S   m     P1     P2
n O Q r