ATRX - ATRX
Regulator transkrypcji ATRX znany również jako ATRX -zależna helikaza ATRX , helikaza II sprzężona z chromosomem X lub białko jądrowe sprzężone z chromosomem X (XNP) to białko, które u ludzi jest kodowane przez gen ATRX .
Funkcjonować
Regulator transkrypcji ATRX zawiera domenę ATPazy / helikazy , a zatem należy do rodziny białek remodelujących chromatynę SWI/SNF . ATRX jest wymagane do odkładania wariantu histonu H3.3 w telomerach i innych powtórzeniach genomowych. Te interakcje są ważne dla utrzymania wyciszenia w tych miejscach.
Ponadto ATRX podlega fosforylacji zależnej od cyklu komórkowego, która reguluje jego macierz jądrową i asocjację chromatyny, co sugeruje jego udział w regulacji genów w interfazie i segregacji chromosomów w mitozie.
Znaczenie kliniczne
Odziedziczone mutacje
Dziedziczne mutacje genu ATRX są związane z zespołem upośledzenia umysłowego sprzężonego z chromosomem X ( XLMR ), któremu najczęściej towarzyszy zespół alfa-talasemii ( ATR-X ). Wykazano, że te mutacje powodują różnorodne zmiany we wzorze metylacji DNA , co może stanowić powiązanie między przebudową chromatyny, metylacją DNA i ekspresją genów w procesach rozwojowych. Opisano wiele wariantów transkrypcyjnych o alternatywnym splicingu kodujących różne izoformy. Samice nośniki mogą wykazywać wypaczone X inaktywacji chromosomu .
Mutacje somatyczne
Nabyte mutacje w ATRX zgłaszano w wielu ludzkich nowotworach, w tym guzach neuroendokrynnych trzustki, glejakach, gwiaździakach, kostniakomięsakach i złośliwych guzach chromochłonnych. Istnieje silna korelacja między mutacjami ATRX a fenotypem alternatywnego wydłużenia telomerów (ALT) w nowotworach.
Interakcje
ATRX tworzy kompleks z DAXX, który jest chaperonem histonu H3.3.
Wykazano również, że ATRX wchodzi w interakcję z EZH2 .
Zobacz też
Bibliografia
Dalsza lektura
- Mulley JC, Kerr B, Stevenson R, Lubs H (1992). „Wytyczne dotyczące nomenklatury upośledzenia umysłowego sprzężonego z chromosomem X”. American Journal of Medical Genetics . 43 (1–2): 383–91. doi : 10.1002/ajmg.1320430159 . PMID 1605216 .
- Tang P, Park DJ, Marshall Graves JA, Harley VR (wrzesień 2004). „ATRX i zróżnicowanie płci”. Trendy w endokrynologii i metabolizmie . 15 (7): 339–44. doi : 10.1016/j.tem.2004.07.006 . PMID 15350606 . S2CID 22192941 .
- Zapomnij o BG (marzec 2006). „De novo i nabyte formy talasemii alfa”. Bieżące raporty hematologiczne . 5 (1): 11–4. PMID 16537041 .
- Adès LC, Kerr B, Turner G, Wise G (wrzesień 1991). „Zespół Smith-Fineman-Myers u dwóch braci”. American Journal of Medical Genetics . 40 (4): 467–70. doi : 10.1002/ajmg.1320400419 . PMID 1684092 .
- Sutherland GR, Gedeon AK, Haan EA, Woodroffe P, Mulley JC (1988). „Badania powiązania z genem dla zespołu sprzężonego z chromosomem X upośledzenia umysłowego, małogłowie i spastycznej diplegii (MRX2)”. American Journal of Medical Genetics . 30 (1–2): 493–508. doi : 10.1002/ajmg.1320300152 . PMID 3177467 .
- Shapiro MB, Senapathy P (wrzesień 1987). „Złącza splicingowe RNA różnych klas eukariontów: statystyki sekwencji i implikacje funkcjonalne w ekspresji genów” . Badania kwasów nukleinowych . 15 (17): 7155–74. doi : 10.1093/nar/15.17.7155 . PMC 306199 . PMID 3658675 .
- Gibbons RJ, Picketts DJ, Villard L, Higgs DR (marzec 1995). „Mutacje w domniemanym globalnym regulatorze transkrypcji powodują niedorozwój umysłowy związany z chromosomem X z talasemią alfa (zespół ATR-X)” . Komórka . 80 (6): 837–45. doi : 10.1016/0092-8674(95)90287-2 . PMID 7697714 .
- Wang LH, Collins A, Lawrence S, Keats BJ, Morton NE (sierpień 1994). „Integracja map genów: chromosom X”. Genomika . 22 (3): 590-604. doi : 10.1006/geno.1994.1432 . PMID 8001970 .
- Gecz J, Pollard H, Consalez G, Villard L, Stayton C, Millasseau P, Khrestchatisky M, Fontes M (styczeń 1994). „Klonowanie i ekspresja mysiego homologu przypuszczalnego ludzkiego genu białka jądrowego związanego z chromosomem X, ściśle związanego z PGK1 w Xq13.3”. Genetyka molekularna człowieka . 3 (1): 39–44. doi : 10,1093/hmg/3.1.39 . PMID 8162050 .
- Villard L, Gecz J, Mattéi JF, Fontés M, Saugier-Veber P, Munnich A, Lyonnet S (kwiecień 1996). „Mutacja XNP w dużej rodzinie z zespołem Juberg-Marsidi”. Genetyka przyrody . 12 (4): 359–60. doi : 10.1038/ng0496-359 . PMID 8630485 . S2CID 33759894 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (wrzesień 1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrycie genów” . Badania genomu . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Picketts DJ, Higgs DR, Bachoo S, Blake DJ, Quarrell OW, Gibbons RJ (grudzień 1996). „ATRX koduje nowego członka rodziny białek SNF2: mutacje wskazują na wspólny mechanizm leżący u podstaw zespołu ATR-X” . Genetyka molekularna człowieka . 5 (12): 1899-907. doi : 10.1093/hmg/5.12.1899 . PMID 8968741 .
- Villard L, Lacombe D, Fontés M (1997). „Mutacja punktowa w genie XNP, związana z fenotypem ATR-X bez talasemii alfa”. European Journal of Human Genetics . 4 (6): 316–20. doi : 10.1159/000472225 . PMID 9043863 . S2CID 43618843 .
- Villard L, Lossi AM, Cardoso C, Proud V, Chiaroni P, Colleaux L, Schwartz C, Fontés M (lipiec 1997). „Określenie struktury genomowej genu XNP / ATRX kodującego potencjalną helikazę palca cynkowego”. Genomika . 43 (2): 149–55. doi : 10.1006/geno.1997.4793 . PMID 9244431 .
- Golub EI, Kovalenko OV, Gupta RC, Ward DC, Radding CM (październik 1997). „Oddziaływanie ludzkich białek rekombinacyjnych Rad51 i Rad54” . Badania kwasów nukleinowych . 25 (20): 4106–10. doi : 10.1093/nar/25.20.4106 . PMC 147015 . PMID 9321665 .
- Gibbons RJ, Bachoo S, Picketts DJ, Aftimos S, Asenbauer B, Bergoffen J, Berry SA, Dahl N, Fryer A, Keppler K, Kurosawa K, Levin ML, Masuno M, Neri G, Pierpont ME, Slaney SF, Higgs DR (październik 1997). „Mutacje w regulatorze transkrypcji ATRX ustalić funkcjonalne znaczenie domeny podobnej do PHD”. Genetyka przyrody . 17 (2): 146-8. doi : 10.1038/ng1097-146 . PMID 9326931 . S2CID 12470300 .
- Cardoso C, Timsit S, Villard L, Khrestchatisky M, Fontès M, Colleaux L (kwiecień 1998). „Swoiste oddziaływanie między produktem genu XNP/ATR-X a domeną SET ludzkiego białka EZH2” . Genetyka molekularna człowieka . 7 (4): 679–84. doi : 10,1093/hmg/7,4.679 . PMID 9499421 .
- Bérubé NG, Mangelsdorf M, Jagla M, Vanderluit J, Garrick D, Gibbons RJ, Higgs DR, Slack RS, Picketts DJ (luty 2005). „Białko ATRX remodelujące chromatynę ma kluczowe znaczenie dla przeżycia neuronów podczas kortykogenezy” . Journal of Clinical Investigation . 115 (2): 258–67. doi : 10.1172/JCI22329 . PMC 544602 . PMID 15668733 .
Linki zewnętrzne
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW wpis dotyczący zespołu upośledzenia umysłowego związanego z alfa-talasemią z chromosomem X; zespół ATRX; alfa talasemia/upośledzenie umysłowe, sprzężone z chromosomem X; XLMR-hipotoniczny zespół twarzy
- Wpisy OMIM dotyczące zespołu upośledzenia umysłowego związanego z alfa-talasemią z chromosomem X
- Lokalizacja ludzkiego genomu ATRX i strona szczegółów genu ATRX w UCSC Genome Browser .
- Lokalizacja genomu ludzkiego RAD54L i strona szczegółów genu RAD54L w UCSC Genome Browser .